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目的 基于综合生物信息学分析,构建喉鳞状细胞癌(LSCC)预后模型,并筛选出LSCC的靶向分子药物.方法 从TCGA数据库下载123个LSCC和正常对照样本的基因表达矩阵及患者临床信息,进行综合生物信息学分析,包括加权基因共表达网络分析(WGCNA),预后相关的免疫基因(PI-genes)的鉴定,LSCC预后模型的构建及其差异基因分析、生存分析、风险分析、独立预后分析和ROC曲线绘制,以及LSCC潜在靶向药物的筛选.结果 对1 352个免疫相关mRNAs(I-mRNAs)和各临床性状构建了加权基因共表达网络,找到了 2个与LSCC患者生存状态最相关的模块(棕色和红色模块).然后鉴定了26 个 PI-genes,构建了基于 8 个候选 PI-genes(CPI-genes)(KC877982.1、AC017100.1、AATBC、LINC02031、ULBP1、SEMA6C、NRTN和CALCB)的LSCC预后模型.通过后续分析可知,该预后模型可预测高、低风险组患者的生存及风险预后,并验证了预后模型的独立预测能力及预测准确性.最后鉴定了 5个LSCC的潜在靶向药物(Rilmenidine、Hycanthone、Anisomycin、Megestrol和AR-A014418).结论 构建了基于8个CPI-genes的LSCC预后模型,筛选了 5个潜在的靶向分子药物,有望对LSCC的预后预测及精准治疗提供新思路.

作者:张永红;张辉;王彩华;杨欣欣;吴允刚;赵玉凤;庞太忠;李晓瑜

来源:山东大学耳鼻喉眼学报 2023 年 37卷 5期

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作者:
张永红;张辉;王彩华;杨欣欣;吴允刚;赵玉凤;庞太忠;李晓瑜
来源:
山东大学耳鼻喉眼学报 2023 年 37卷 5期
标签:
喉鳞状细胞癌 免疫相关基因 预后模型 靶向药物 生物信息学分析 Laryngeal squamous cell carcinoma Immune-associated genes Prognostic model Targeted drugs Bioinformatics analysis
目的 基于综合生物信息学分析,构建喉鳞状细胞癌(LSCC)预后模型,并筛选出LSCC的靶向分子药物.方法 从TCGA数据库下载123个LSCC和正常对照样本的基因表达矩阵及患者临床信息,进行综合生物信息学分析,包括加权基因共表达网络分析(WGCNA),预后相关的免疫基因(PI-genes)的鉴定,LSCC预后模型的构建及其差异基因分析、生存分析、风险分析、独立预后分析和ROC曲线绘制,以及LSCC潜在靶向药物的筛选.结果 对1 352个免疫相关mRNAs(I-mRNAs)和各临床性状构建了加权基因共表达网络,找到了 2个与LSCC患者生存状态最相关的模块(棕色和红色模块).然后鉴定了26 个 PI-genes,构建了基于 8 个候选 PI-genes(CPI-genes)(KC877982.1、AC017100.1、AATBC、LINC02031、ULBP1、SEMA6C、NRTN和CALCB)的LSCC预后模型.通过后续分析可知,该预后模型可预测高、低风险组患者的生存及风险预后,并验证了预后模型的独立预测能力及预测准确性.最后鉴定了 5个LSCC的潜在靶向药物(Rilmenidine、Hycanthone、Anisomycin、Megestrol和AR-A014418).结论 构建了基于8个CPI-genes的LSCC预后模型,筛选了 5个潜在的靶向分子药物,有望对LSCC的预后预测及精准治疗提供新思路.

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