目的 基于转录组测序分析碘乙酸钠(monosodium iodoacetate,MIA)诱导的膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)大鼠相比于正常组大鼠滑膜组织中的表达差异基因,并初步筛选出秦皮素(fraxetin)治疗滑膜炎的靶点.方法 将SD大鼠分为KOA模型组和对照组,采用MIA膝关节注射法制备大鼠右膝KOA模型.造模4周后,取各组大鼠右膝滑膜组织进行转录组测序,获得了KOA模型组与对照组大鼠滑膜组织中mRNA差异表达情况,然后进行差异基因表达分析、GO富集分析、KEGG功能富集分析和PPI蛋白网络互作分析.同时将巨噬细胞Raw264.7分为对照组、脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)干预组和LPS+60μmol/L秦皮素联合干预组,并采用实时荧光定量PCR法对转录组测序后的差异基因分析结果进行验证.结果 转录组测序后的差异基因表达分析显示,KOA模型组与对照组相比,共有1730个上调基因和1546个下调基因,其中显著上调的基因有mmp12、Acod1、Acan、Col2a1和Atp6v0d2等[|log2(FoldChange)|≥1,校正后P<0.01].KEGG聚类分析和GO聚类分析显示,差异基因主要参与调节炎症及免疫代谢过程,例如三羧酸循环、线粒体功能.LPS干预后的Raw264.7细胞中Acod1与Atp6v0d2显著高表达(P<0.0001),而且相较于LPS干预组,LPS+秦皮素联合干预后的Raw264.7细胞中Atp6v0d2表达

作者：杨凌；庄迪；金立伦

来源：实验动物与比较医学 2023 年 43卷 1期