目的 基于生物信息学方法构建肺腺癌(LUAD)-细胞焦亡基因预后风险模型,探讨LUAD与细胞焦亡的关系.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载LUAD患者的转录组数据(TCGA队列)和临床资料,采用limma程序包鉴别差异表达的焦亡基因.根据差异焦亡基因的表达特征对TCGA队列进行聚类分析,以获得聚类分型,鉴定不同聚类分型间的差异表达基因.采用LASSO-Cox回归分析建立基于不同聚类分型差异表达基因的预后风险模型,并计算风险评分.依据风险评分的中位值将TCGA队列的LUAD患者分为高风险组、低风险组.结合临床病理特征,采用Kaplan-Meier生存曲线和Cox回归分析探讨预后风险模型的临床价值.根据TCGA队列的风险评分中位值将从基因表达综合(GEO)数据库中筛选出的LUAD患者分为高风险组和低风险组,对预后风险模型进行验证.对TCGA队列高、低风险组差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)富集分析.采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)和CIBERSORT程序包对TCGA队列的免疫细胞和免疫相关通路进行量化和比较.结果 在LUAD癌组织和癌旁组织中鉴定出41个差异表达的焦亡基因.聚类分析结果显示,TCGA队列样本可分为2个聚类分型,分型2的生存期显著长于分型1(P<0.05).鉴定出11个与LUAD患者生存相关的差异表达基因(ANO
作者：王杨淑怡；叶威；林志豪；黄约诺；方涛；董晓亭
来源：检验医学 2023 年 38卷 9期
