目的:分析结核分枝杆菌(MTB)抗原Rv2389的T细胞表位,确定和筛选优势表位,为研制更加有效的诊断标志物,和更安全、高效的表位疫苗奠定基础.方法:应用在线预测软件IEDB和SYFPEITHI对MTB抗原Rv2389的T细胞表位进行预测,并与ESAT-6相比较;采用SOPMA Sever软件预测其编码蛋白的二级结构;用ExPASy在线软件预测Rv2389的三级结构,综合分析Rv2389的T细胞抗原决定簇.结果:经软件分析,Rv2389多肽预测分值普遍高于ESAT-6,Rv2389分值较高的T细胞表位区域氨基酸位于35～43、85～93、107～126和184～200.MTB抗原Rv2389蛋白无规则卷曲占71.89％,β折叠占5.53％,主要覆盖的氨基酸区域位14～23,51～67,72～112,117～127和134～212.说明这些肽段存在潜在的抗原表位优势区域的可能性;三级结构预测显示,85～93位氨基酸和107～126位氨基酸暴露于蛋白表面,是最有可能的抗原表位.结论:经生物信息学软件预测MTB抗原Rv2389有2个T细胞优势表位,即85～93位和107～126位氨基酸.
作者：李艳华；肖云峰；周磊；杨柳；郝晓柯；马越云
来源：现代生物医学进展 2015 年 15卷 26期
