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全面了解中国乌骨鸡的遗传背景有利于保护和开发利用其种质资源.本研究测定了中国12个乌骨鸡品种线粒体细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因,比较分析其遗传多样性和群体遗传结构.255份乌骨鸡样品共检测到22个变异位点,占分析位点的3.17%;核苷酸多样性为0.00142-0.00339,单倍型多样性为0.380-0.757,其中略阳乌鸡核苷酸多样性最高,德化黑鸡最低.检测到7个氨基酸变异位点,来自6个品种共11个个体.定义了24种单倍型,其中单倍型H1和H3为12个乌骨鸡品种共享,出现频率分别为115次和64次;盐津乌骨鸡单倍型数最多,广西乌鸡最少.中性检验与错配分析显示实验种群未经历显著的群体扩张事件.分子变异分析显示81.06%的变异来自群体内;品种间遗传距离为0.002-0.004,品种间遗传分化系数Fst值为-0.035至0.594,雪峰乌骨鸡与其他种群间的遗传分化程度最高.邻接树显示,乌骨鸡未能独立形成分支,不能从家鸡和红原鸡中有效区分开来.中国乌骨鸡中介网络图将24个单倍型分为3条进化主支,呈现出一定的品种特异性,由无量山乌骨鸡、云南盐津乌骨鸡和雪峰乌骨鸡组成单倍型H8、H9、H11、H12游离于这3条进化主支之外.增加其他家鸡和红原鸡COI基因的中介网络图主体结构与中国乌骨鸡的相同.结果 表明中国乌骨

作者:翁茁先;黄佳琼;张仕豪;余锴纯;钟福生;黄勋和;张彬

来源:生物多样性 2019 年 27卷 6期

知识库介绍

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翁茁先;黄佳琼;张仕豪;余锴纯;钟福生;黄勋和;张彬
来源:
生物多样性 2019 年 27卷 6期
标签:
乌骨鸡 线粒体COI基因 遗传变异 遗传分化
全面了解中国乌骨鸡的遗传背景有利于保护和开发利用其种质资源.本研究测定了中国12个乌骨鸡品种线粒体细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因,比较分析其遗传多样性和群体遗传结构.255份乌骨鸡样品共检测到22个变异位点,占分析位点的3.17%;核苷酸多样性为0.00142-0.00339,单倍型多样性为0.380-0.757,其中略阳乌鸡核苷酸多样性最高,德化黑鸡最低.检测到7个氨基酸变异位点,来自6个品种共11个个体.定义了24种单倍型,其中单倍型H1和H3为12个乌骨鸡品种共享,出现频率分别为115次和64次;盐津乌骨鸡单倍型数最多,广西乌鸡最少.中性检验与错配分析显示实验种群未经历显著的群体扩张事件.分子变异分析显示81.06%的变异来自群体内;品种间遗传距离为0.002-0.004,品种间遗传分化系数Fst值为-0.035至0.594,雪峰乌骨鸡与其他种群间的遗传分化程度最高.邻接树显示,乌骨鸡未能独立形成分支,不能从家鸡和红原鸡中有效区分开来.中国乌骨鸡中介网络图将24个单倍型分为3条进化主支,呈现出一定的品种特异性,由无量山乌骨鸡、云南盐津乌骨鸡和雪峰乌骨鸡组成单倍型H8、H9、H11、H12游离于这3条进化主支之外.增加其他家鸡和红原鸡COI基因的中介网络图主体结构与中国乌骨鸡的相同.结果 表明中国乌骨

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