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随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生.介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围.用Helicobacter acinonychis的Illumina 1G测序数据检测SSAKE,VCAKE,SHARCGS以及velvet的性能,并对未来拼接算法的研究提出展望.

作者:逯雯雯;卢志远;王亚旭;孙啸

来源:生物信息学 2010 年 08卷 3期

知识库介绍

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逯雯雯;卢志远;王亚旭;孙啸
来源:
生物信息学 2010 年 08卷 3期
标签:
基因组测序 序列拼接 短片段
随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生.介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围.用Helicobacter acinonychis的Illumina 1G测序数据检测SSAKE,VCAKE,SHARCGS以及velvet的性能,并对未来拼接算法的研究提出展望.

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