三疣梭子蟹是中国重要的水产养殖动物.目前,其养殖业的蟹苗主要还是依靠野生资源,但种质(生长速度、肌肉品质和抗病性)退化现象严重,因此迫切需要了解个体、种群和物种遗传多样性.报道了一种检测三疣梭子蟹多样性芯片技术(diversity arrays technology,DArT).DArT技术采用芯片可同时检测数百个基因座,即使没有基因组DNA序列信息也可以分析遗传多态性.采用了PstL/Taq Ⅰ复杂性降低方法,多态性效率为12.5%.利用多样性芯片杂交获得313个DArT标记.这些DArT标记用于点制多态性富集芯片,DArT标记具有较高的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC).最后根据0/1矩阵获得UPGMA系统进化树,结果表明样品间的遗传多样性与文献报道一致.芯片质量检测中包括赋值重复性为99.1%,同一样品不同个体间的差异不显著,其差异介于0.7% ~ 1.6%.研究表明,DArT技术具有高通量和低成本的显著特点,该技术可为三疣梭子蟹资源保护和良种选育提供支持.
作者:荣晔婧;陈强;史雨红;陈炯
来源:生物学杂志 2014 年 31卷 2期