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目的:通过筛选早产胎盘组织中的差异表达基因,寻找早产相关因子。方法收集16例早产儿胎盘样本和同期出生的20例足月产儿胎盘样本,随机选取其中9例早产儿和4例足月产胎盘样本,采用表达谱基因芯片法筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG通路分析,选择显著差异表达的基因进行实时荧光定量PCR( qRT-PCR)验证。结果检测到差异表达基因75个,其中PSG9等9个基因表达上调;LEP等66个基因表达下调。对75个差异表达的基因进行GO功能注释分析,显示差异表达基因主要参与抗原加工提呈、免疫应答、损伤应答和系统进程调节等。 KEGG通路分析结果显示,差异表达的基因包括全身性同种异体移植物排斥相关基因、红斑狼疮相关基因、哮喘相关基因、移植物抗宿主相关基因等与信号通路相关的作用基因。扩大样本量对显著差异表达的PSG9、CRH、PAPPA2和INHBA四个基因进行qRT-PCR验证,结果表明, PSG9基因在病例组中表达上调1.82倍;而CRH、PAPPA2和INHBA基因在病例组中表达分别下调3.28倍、2.98倍和2.19倍,与基因芯片技术检测结果相符。结论与足月产相比,早产儿胎盘组织中存在差异表达基因,这些差异表达基因可能与早产的发生有关。

作者:孙健;汪云;陶建英;陈瑛

来源:山西医科大学学报 2015 年 12期

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作者:
孙健;汪云;陶建英;陈瑛
来源:
山西医科大学学报 2015 年 12期
标签:
早产 胎盘 基因芯片 基因表达谱 preterm birth placenta microarray expression profiling
目的:通过筛选早产胎盘组织中的差异表达基因,寻找早产相关因子。方法收集16例早产儿胎盘样本和同期出生的20例足月产儿胎盘样本,随机选取其中9例早产儿和4例足月产胎盘样本,采用表达谱基因芯片法筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG通路分析,选择显著差异表达的基因进行实时荧光定量PCR( qRT-PCR)验证。结果检测到差异表达基因75个,其中PSG9等9个基因表达上调;LEP等66个基因表达下调。对75个差异表达的基因进行GO功能注释分析,显示差异表达基因主要参与抗原加工提呈、免疫应答、损伤应答和系统进程调节等。 KEGG通路分析结果显示,差异表达的基因包括全身性同种异体移植物排斥相关基因、红斑狼疮相关基因、哮喘相关基因、移植物抗宿主相关基因等与信号通路相关的作用基因。扩大样本量对显著差异表达的PSG9、CRH、PAPPA2和INHBA四个基因进行qRT-PCR验证,结果表明, PSG9基因在病例组中表达上调1.82倍;而CRH、PAPPA2和INHBA基因在病例组中表达分别下调3.28倍、2.98倍和2.19倍,与基因芯片技术检测结果相符。结论与足月产相比,早产儿胎盘组织中存在差异表达基因,这些差异表达基因可能与早产的发生有关。

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