目的 通过对肥胖相关基因芯片进行生物信息学分析, 探讨肥胖治疗的新靶点.方法 从基因表达数据库 (GEO) 下载Roux-en-Y减重手术 (RYGB) 前后肥胖Sprague-Dawley (SD) 大鼠脂肪组织相关基因表达谱数据GSE8314, 利用R语言筛选差异基因, 利用DAVID数据库对差异基因进行GO和KEGG pathway富集分析, 利用STRING在线工具进行PPI网络构建.结果 共筛选出890个RYGB术前后SD大鼠脂肪组织差异表达基因, 其中上调基因386个, 下调基因504个.GO分析发现, 这些差异基因主要参与25个生物学过程, 3个分子功能, 12个细胞组分.KEGG pathway富集分析发现这些差异基因主要涉及蛋白质消化吸收 (rno04974) 、细胞色素P450对异生素的代谢 (rno00980) 、药物代谢-细胞色素P450 (rno00982) 、花生四烯酸代谢 (rno00590) 、脂肪细胞因子信号通路 (rno04920) 等.利用STRING在线工具分析发现, 这些差异基因编码的蛋白存在相互作用.Bdkrb1, Ccl6, Pf4为蛋白-蛋白相互作用网络中的核心节点.结论 通过对GSE8314芯片数据进行挖掘发现, RYGB术后SD大鼠脂肪组织的基因表达有明显差异, 并筛选出肥胖密切相关的基因Bdkrb1、PF4, 后者有可能成为肥胖的药理学治疗靶点.
作者：申晶；苗俊秋；高丽娟；王德平；左琳；曹济民
来源：山西医科大学学报 2019 年 50卷 4期
