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目的:通过生物信息学分析、免疫组化实验和临床队列研究,探讨GPX8在乳腺癌中的差异表达、诊断和预后价值.方法:我们从UCSC Xena数据库中获取了癌症患者的GPX8基因表达、RNAseq、DNA甲基化、生存期、表型、干性分数和临床信息数据,并进行了 Kaplan-Meier生存预后分析和甲基化水平探索.利用肿瘤免疫评估资源(tumor immune estimation resource,TIMER)评估了乳腺癌中GPX8和肿瘤浸润淋巴细胞之间的相关性,并利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)分析了受GPX8影响的潜在功能通路.对125例乳腺癌患者癌组织样本进行了 GPX8的免疫组化染色、HE染色,并对患者进行临床随访分析.采用Chi-square检验和Cox回归分析了 GPX8在不同亚组的表达水平与预后的关系.结果:基因表达谱交互分析(gene expression profiling interaction analysis,GEPIA)和 TIMER 分析显示,乳腺癌患者的GPX8 mRNA表达在癌组织中较高,且预后存在明显差异.GPX8主要在细胞质和细胞膜中呈阳性定位,各组间GPX8蛋白表达有显著差异.在TIMER数据库中GPX8 mRNA表达与CD8+T、B细胞、NK、Treg细胞浸润负相关,在临床队列中与TNM分期、T分期和分子亚型相关,其中在三阴性乳腺癌患者中GPX8和TILs表达水平负相关.GPX8 mRNA过表达可预测乳腺癌患者

作者:李贺;赵艳春;韩建军;卓见;戴璐娴;盛安康;姚汉玉;刘伟光

来源:现代肿瘤医学 2024 年 32卷 5期

知识库介绍

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作者:
李贺;赵艳春;韩建军;卓见;戴璐娴;盛安康;姚汉玉;刘伟光
来源:
现代肿瘤医学 2024 年 32卷 5期
标签:
乳腺癌 GPX8 预后 肿瘤浸润淋巴细胞 三阴性乳腺癌 breast cancer GPX8 prognosis TILs TNBC
目的:通过生物信息学分析、免疫组化实验和临床队列研究,探讨GPX8在乳腺癌中的差异表达、诊断和预后价值.方法:我们从UCSC Xena数据库中获取了癌症患者的GPX8基因表达、RNAseq、DNA甲基化、生存期、表型、干性分数和临床信息数据,并进行了 Kaplan-Meier生存预后分析和甲基化水平探索.利用肿瘤免疫评估资源(tumor immune estimation resource,TIMER)评估了乳腺癌中GPX8和肿瘤浸润淋巴细胞之间的相关性,并利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)分析了受GPX8影响的潜在功能通路.对125例乳腺癌患者癌组织样本进行了 GPX8的免疫组化染色、HE染色,并对患者进行临床随访分析.采用Chi-square检验和Cox回归分析了 GPX8在不同亚组的表达水平与预后的关系.结果:基因表达谱交互分析(gene expression profiling interaction analysis,GEPIA)和 TIMER 分析显示,乳腺癌患者的GPX8 mRNA表达在癌组织中较高,且预后存在明显差异.GPX8主要在细胞质和细胞膜中呈阳性定位,各组间GPX8蛋白表达有显著差异.在TIMER数据库中GPX8 mRNA表达与CD8+T、B细胞、NK、Treg细胞浸润负相关,在临床队列中与TNM分期、T分期和分子亚型相关,其中在三阴性乳腺癌患者中GPX8和TILs表达水平负相关.GPX8 mRNA过表达可预测乳腺癌患者

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