目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,对肝细胞癌(HCC)组织异常表达的RNA结合蛋白(RBPs)进行系统生物信息学分析,筛选预后标志物和潜在的治疗靶点.方法 从TCGA中下载HCC组织RNA测序数据,测定HCC组织和正常组织差异表达的RBPs,进行功能富集分析和相互作用关系的可视化分析.应用单因素和多因素Cox回归分析筛选与预后显著相关的RBPs并构建预后模型.通过生存分析和ROC曲线分析对预后模型的预测性能进行评估,并在验证队列中进行验证.应用人类蛋白质图谱(HPA)在线数据库对预后模型中RBPs水平进行验证.结果 鉴定出82个差异表达的RBPs,其中55个上调,27个下调;进一步功能富集分析和相互作用研究发现主要与mRNA代谢调控、RNA和mRNA分解代谢、高分子甲基化等有关;LIN28B、SMG5、PPARGC1A、LARP1B和ANG5个RBPs被鉴定为与预后相关的基因,被用于构建预后模型;在验证序列中验证了该预后模型的预测能力,经ROC曲线分析显示该预后模型具有较好的敏感性和特异性;独立预后分析显示,风险得分可作为HCC独立的预后因素.结论 本研究通过对HCC差异表达的RBPs进行分析,构建了一个预后预测模型,可能有利于对HCC预后生物标志物和治疗靶点的筛选.
作者：吴桐；张巧丽；齐雪维
来源：实用肝脏病杂志 2022 年 25卷 5期
