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目的 探讨丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)低病毒载量时,HCV核心蛋白(Core)和Core/包膜蛋白1(envelope protein 1,E1)区直接测序法对HCV基因分型的影响.方法 HCV-RNA 103~< 104拷贝/mL患者30例,采集其血清标本,采用巢式PCR对Core和Core/E1区分别扩增,产物直接测序,构建进化树进行基因分型.结果 Core区扩增阳性25例(83.3%),其中1b型15例,2a型5例,3a型2例和6a型3例;Core/E1区扩增阳性19例(63.3%),其中1b型11例,2a型4例,3a型2例和6a型2例.结论 当HCV-RNA载量较低时,Core区较Core/E1区有较高扩增效率和准确性,是临床或科研中应用直接测序法对HCV基因分型较理想的基因区.

作者:奚琳琳;靳秀;蔡庆春;丁瑞敏;李威;尚佳

来源:中华实用诊断与治疗杂志 2016 年 30卷 5期

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作者:
奚琳琳;靳秀;蔡庆春;丁瑞敏;李威;尚佳
来源:
中华实用诊断与治疗杂志 2016 年 30卷 5期
标签:
丙型肝炎病毒 基因型 核心蛋白 包膜蛋白1 低病毒载量 Hepatitis C virus genotype Core envelope protein 1 lower viral load
目的 探讨丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)低病毒载量时,HCV核心蛋白(Core)和Core/包膜蛋白1(envelope protein 1,E1)区直接测序法对HCV基因分型的影响.方法 HCV-RNA 103~< 104拷贝/mL患者30例,采集其血清标本,采用巢式PCR对Core和Core/E1区分别扩增,产物直接测序,构建进化树进行基因分型.结果 Core区扩增阳性25例(83.3%),其中1b型15例,2a型5例,3a型2例和6a型3例;Core/E1区扩增阳性19例(63.3%),其中1b型11例,2a型4例,3a型2例和6a型2例.结论 当HCV-RNA载量较低时,Core区较Core/E1区有较高扩增效率和准确性,是临床或科研中应用直接测序法对HCV基因分型较理想的基因区.

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