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[目的]研究腹泻犊牛直肠细菌多样性,以及与健康犊牛直肠细菌多样性的差异.[方法]通过建立直肠菌群16S rRNA基因克隆文库,分别用限制性内切酶Msp Ⅰ和HhaⅠ对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,通过测定16S rRNA基因序列,绘制系统发育树,确定犊牛直肠菌群的组成.[结果]腹泻组克隆阳性率达98.75% (474/480),优势菌群以乳杆菌属(14%)、肠球菌属(10%)和埃希菌属(8%)等需氧和兼性厌氧菌为主,健康组克隆阳性率达96.45%(488/506),优势菌群以梭菌属(13%)、双歧杆菌属(8%)和巨型球菌属(5%)等专性厌氧菌为主.[结论]2周龄犊牛直肠菌群复杂多样,并且具有自己的独特性菌群,且腹泻时乳杆菌属、肠球菌属、埃希氏菌属等显著增加.

作者:许强;康立超;薄新文;马勋

来源:微生物学报 2012 年 52卷 3期

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作者:
许强;康立超;薄新文;马勋
来源:
微生物学报 2012 年 52卷 3期
标签:
犊牛直肠 微生物多样性 RFLP 16S rRNA序列
[目的]研究腹泻犊牛直肠细菌多样性,以及与健康犊牛直肠细菌多样性的差异.[方法]通过建立直肠菌群16S rRNA基因克隆文库,分别用限制性内切酶Msp Ⅰ和HhaⅠ对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,通过测定16S rRNA基因序列,绘制系统发育树,确定犊牛直肠菌群的组成.[结果]腹泻组克隆阳性率达98.75% (474/480),优势菌群以乳杆菌属(14%)、肠球菌属(10%)和埃希菌属(8%)等需氧和兼性厌氧菌为主,健康组克隆阳性率达96.45%(488/506),优势菌群以梭菌属(13%)、双歧杆菌属(8%)和巨型球菌属(5%)等专性厌氧菌为主.[结论]2周龄犊牛直肠菌群复杂多样,并且具有自己的独特性菌群,且腹泻时乳杆菌属、肠球菌属、埃希氏菌属等显著增加.

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