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目的:研究肝纤维化模型小鼠肝组织中环状RNA(circRNA)表达谱变化.方法:制备经典的CCl4小鼠肝纤维化模型,设立正常对照组,采用高通量circRNA芯片技术比较2组小鼠肝组织circRNA表达谱变化,根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选出目标circRNA,RT-qPCR验证其在肝组织中的表达,借助生物信息学软件预测可能受其调控的微小RNA(miRNA).结果:HE染色和Masson染色显示,模型组小鼠肝组织炎症和纤维化明显,模型复制成功.与正常组和模型组肝组织差异表达的circRNA共有69个(表达差异2倍以上,P<0.05),其中模型组上调4倍以上的有1个,下调4倍以上的有5个,RT-qPCR实验证实5个circRNA变化趋势与芯片结果一致,其中4个差异有统计学意义(P<0.05),生物信息学分析结合文献检索显示,mmu_circ_42398、mmu_circ_42397可能通过结合miR-338-3p,而mmu_circ_34116可能通过结合miR-141-5p,参与肝纤维化发病机制.结论:circRNA与肝纤维化发生发展过程存在一定关联,circRNA可能参与了肝纤维化的发病机制.

作者:周玉平;吕雪幼;璩辉;朱林文;叶国良;郭俊明

来源:温州医科大学学报 2018 年 48卷 8期

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作者:
周玉平;吕雪幼;璩辉;朱林文;叶国良;郭俊明
来源:
温州医科大学学报 2018 年 48卷 8期
标签:
肝纤维化 环状RNA 差异表达谱 小鼠
目的:研究肝纤维化模型小鼠肝组织中环状RNA(circRNA)表达谱变化.方法:制备经典的CCl4小鼠肝纤维化模型,设立正常对照组,采用高通量circRNA芯片技术比较2组小鼠肝组织circRNA表达谱变化,根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选出目标circRNA,RT-qPCR验证其在肝组织中的表达,借助生物信息学软件预测可能受其调控的微小RNA(miRNA).结果:HE染色和Masson染色显示,模型组小鼠肝组织炎症和纤维化明显,模型复制成功.与正常组和模型组肝组织差异表达的circRNA共有69个(表达差异2倍以上,P<0.05),其中模型组上调4倍以上的有1个,下调4倍以上的有5个,RT-qPCR实验证实5个circRNA变化趋势与芯片结果一致,其中4个差异有统计学意义(P<0.05),生物信息学分析结合文献检索显示,mmu_circ_42398、mmu_circ_42397可能通过结合miR-338-3p,而mmu_circ_34116可能通过结合miR-141-5p,参与肝纤维化发病机制.结论:circRNA与肝纤维化发生发展过程存在一定关联,circRNA可能参与了肝纤维化的发病机制.

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