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目的 预测人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白的B细胞抗原表位,并分析其进化特征.方法 从GISAID和GenBank两大数据库获得人易感H6N1病毒的血凝素蛋白及近缘序列,采用多款预测软件分别预测了其B细胞线性和构象型抗原表位,并分析了这些表位的保守性、适应性和进化特征.结果 综合各种因素共预测出4个线性表位(表位A、B、C和D)和2个构象型表位(表位E和F).表位C和位点41、157、186、187在进化过程中易发生突变,其余表位较为保守,其中表位D最保守;位点157受到强烈的正选择作用,它可能是H6N1病毒逃避宿主免疫系统攻击的一个关键位点.结论 人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白拥有5个保守的B细胞抗原表位(3个线性、2个构象型)和1个正选择作用位点,将为其疫苗的研制、致病机制的理解和病毒防治提供理论基础.

作者:杨建课;袁健;高继光;朱晓蕾;林爱琴

来源:细胞与分子免疫学杂志 2015 年 31卷 1期

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作者:
杨建课;袁健;高继光;朱晓蕾;林爱琴
来源:
细胞与分子免疫学杂志 2015 年 31卷 1期
标签:
人易感H6N1禽流感病毒 血凝素蛋白 抗原表位 生物信息学 进化 human-infecting H6N1 avian influenza virus hemagglutinin epitopes bioinformatics evolution
目的 预测人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白的B细胞抗原表位,并分析其进化特征.方法 从GISAID和GenBank两大数据库获得人易感H6N1病毒的血凝素蛋白及近缘序列,采用多款预测软件分别预测了其B细胞线性和构象型抗原表位,并分析了这些表位的保守性、适应性和进化特征.结果 综合各种因素共预测出4个线性表位(表位A、B、C和D)和2个构象型表位(表位E和F).表位C和位点41、157、186、187在进化过程中易发生突变,其余表位较为保守,其中表位D最保守;位点157受到强烈的正选择作用,它可能是H6N1病毒逃避宿主免疫系统攻击的一个关键位点.结论 人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白拥有5个保守的B细胞抗原表位(3个线性、2个构象型)和1个正选择作用位点,将为其疫苗的研制、致病机制的理解和病毒防治提供理论基础.

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