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根据苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,分别以苦荞DNA和cDNA为模板,克隆得到1个苦养C2C2型锌指蛋白基因FtLSD1(GenBank登录号KP252134)的DNA序列和cDNA序列,采用实时荧光定量PCR方法,研究了FtLSD1基因在非生物胁迫下的表达模式.结果显示:苦荞FtLSD1基因DNA全长2 427 bp,由6个外显子和5个内含子构成,符合GU-AG剪切原则;cDNA序列包含一个528 bp开放阅读框,编码175个氨基酸,具有LSD1家族的典型结构域;UV-B照射和水杨酸处理均能使FtLSD1基因的表达量上升,且UV-B处理在6h达到最大,为0 h(CK)的3.84倍;水杨酸处理于10h达到最大,为0 h(CK)的3.44倍,而4℃冷胁迫下该基因表达量保持稳定.推测该基因可能参与苦荞抗UV-B和高浓度水杨酸等非生物胁迫的应答反应,为苦荞的抗逆性研究提供新的视角.

作者:高飞;姚攀锋;雒晓鹏;李成磊;吴琦;姚慧鹏

来源:西北植物学报 2015 年 35卷 4期

知识库介绍

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作者:
高飞;姚攀锋;雒晓鹏;李成磊;吴琦;姚慧鹏
来源:
西北植物学报 2015 年 35卷 4期
标签:
苦荞 锌指蛋白LSD1 基因克隆 非生物胁迫 Fagopyrum tataricum zinc finger protein LSD1 gene cloning abiotic stress
根据苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,分别以苦荞DNA和cDNA为模板,克隆得到1个苦养C2C2型锌指蛋白基因FtLSD1(GenBank登录号KP252134)的DNA序列和cDNA序列,采用实时荧光定量PCR方法,研究了FtLSD1基因在非生物胁迫下的表达模式.结果显示:苦荞FtLSD1基因DNA全长2 427 bp,由6个外显子和5个内含子构成,符合GU-AG剪切原则;cDNA序列包含一个528 bp开放阅读框,编码175个氨基酸,具有LSD1家族的典型结构域;UV-B照射和水杨酸处理均能使FtLSD1基因的表达量上升,且UV-B处理在6h达到最大,为0 h(CK)的3.84倍;水杨酸处理于10h达到最大,为0 h(CK)的3.44倍,而4℃冷胁迫下该基因表达量保持稳定.推测该基因可能参与苦荞抗UV-B和高浓度水杨酸等非生物胁迫的应答反应,为苦荞的抗逆性研究提供新的视角.

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