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目的 评价以ITS2和matK序列作为DNA条形码对峨眉山区唇形科药用植物的鉴定效果.方法 从峨眉山区采集23种唇形科药用植物样本,提取DNA,PCR扩增ITS2序列,并从Genbank上分别下载54与51条唇形科植物的ITS2及matK序列:使用 MEGA5.0软件计算全部序列的种间、种内遗传距离及序列变异位点,构建 Neighbor Joining(NJ)系统进化树,最后开展 barcoding gap分析.结果 峨眉山唇形科药用植物的 ITS2序列长度为 190~237bp,GC含量为53%~73%,具有较为明显的 barcoding gap,对唇形科植物的识别率为94%,而matK序列的barcoding gap不显著,有明显重叠现象,对唇形科植物的识别率为96%.结论 ITS2从种水平上对唇形科植物有更好的鉴定能力,但matK序列对唇形科植物的识别率更高,因此,以ITS2为主,matK序列为辅的鉴定方法能够对唇形科药用植物进行快速、准确的鉴定和识别,准确阐明物种之间的亲缘关系,对峨眉山区唇形科药用植物资源的有效保护和合理开发提供了理论依据.

作者:郑辉;李秋娥;陈安琪;邓楷煜;廖海;任瑶瑶;周嘉裕;谭睿

来源:中草药 2019 年 50卷 22期

知识库介绍

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作者:
郑辉;李秋娥;陈安琪;邓楷煜;廖海;任瑶瑶;周嘉裕;谭睿
来源:
中草药 2019 年 50卷 22期
标签:
峨眉山 唇形科 DNA条形码 ITS2 matK 遗传距离
目的 评价以ITS2和matK序列作为DNA条形码对峨眉山区唇形科药用植物的鉴定效果.方法 从峨眉山区采集23种唇形科药用植物样本,提取DNA,PCR扩增ITS2序列,并从Genbank上分别下载54与51条唇形科植物的ITS2及matK序列:使用 MEGA5.0软件计算全部序列的种间、种内遗传距离及序列变异位点,构建 Neighbor Joining(NJ)系统进化树,最后开展 barcoding gap分析.结果 峨眉山唇形科药用植物的 ITS2序列长度为 190~237bp,GC含量为53%~73%,具有较为明显的 barcoding gap,对唇形科植物的识别率为94%,而matK序列的barcoding gap不显著,有明显重叠现象,对唇形科植物的识别率为96%.结论 ITS2从种水平上对唇形科植物有更好的鉴定能力,但matK序列对唇形科植物的识别率更高,因此,以ITS2为主,matK序列为辅的鉴定方法能够对唇形科药用植物进行快速、准确的鉴定和识别,准确阐明物种之间的亲缘关系,对峨眉山区唇形科药用植物资源的有效保护和合理开发提供了理论依据.

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