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目的:对rno-microRNA-296-5p(miR-296)靶基因预测并进行相关生物信息学分析,为深入研究miR-296与胎肺发育相关的生物学功能提供理论依据。方法应用PubMed、Google等信息搜索工具检索miR-296的现有研究,并通过miRBase获取其序列特征以及进化的保守性;利用TargetScan数据库进行miR-296的靶基因预测;并利用DAVID Bioinformatics Resources 6.8数据库对靶基因进行功能富集分析;利用KEGG数据库对靶基因进行信号转导通路分析。结果已有的文献表明miR-296在许多生物学过程中发挥重要作用,序列在多物种间高度保守。miR-296调控的靶基因参与分子功能、细胞组分和生物学过程等方面,靶基因集合的信号转导通路显著富集于MAPK信号通路、Wnt信号通路、TGF-β信号通路等(均P<0.05)。结论通过对miR-296靶基因的生物信息学分析,为研究miR-296在肺发育中的作用提供了功能与机制的线索。

作者:张颖慧;杨洋;张存;孙祎璠;朱雯;马程玲;周晓玉

来源:中国当代儿科杂志 2016 年 18卷 12期

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作者:
张颖慧;杨洋;张存;孙祎璠;朱雯;马程玲;周晓玉
来源:
中国当代儿科杂志 2016 年 18卷 12期
标签:
microRNA-296 靶基因 生物信息学 肺发育 microRNA-296 Target gene Bioinformatics Lung development
目的:对rno-microRNA-296-5p(miR-296)靶基因预测并进行相关生物信息学分析,为深入研究miR-296与胎肺发育相关的生物学功能提供理论依据。方法应用PubMed、Google等信息搜索工具检索miR-296的现有研究,并通过miRBase获取其序列特征以及进化的保守性;利用TargetScan数据库进行miR-296的靶基因预测;并利用DAVID Bioinformatics Resources 6.8数据库对靶基因进行功能富集分析;利用KEGG数据库对靶基因进行信号转导通路分析。结果已有的文献表明miR-296在许多生物学过程中发挥重要作用,序列在多物种间高度保守。miR-296调控的靶基因参与分子功能、细胞组分和生物学过程等方面,靶基因集合的信号转导通路显著富集于MAPK信号通路、Wnt信号通路、TGF-β信号通路等(均P<0.05)。结论通过对miR-296靶基因的生物信息学分析,为研究miR-296在肺发育中的作用提供了功能与机制的线索。

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