目的:探讨动脉粥样硬化(AS)进展中差异免疫相关基因(DIRGs)与免疫细胞的相关性及干预DIRGs中药的一般规律.方法:首先,从GEO数据库中获取GSE28829数据集,从ImmPort数据库和MSigDB数据库中下载免疫相关基因.其次,利用limma包筛选GSE28829中早期AS斑块(EAP)和晚期AS斑块(AAP)间的差异表达基因,并与免疫相关基因取交集获取DIRGs;clusterProfiler包对DIRGs进行富集分析;构建DIRGs的蛋白互作网络,筛选网络中Hub基因.然后利用CIBERSORT反卷积法分析22种免疫细胞的浸润模式,筛选差异免疫细胞,并利用Pearson法分析其与Hub基因的相关性.最后,利用Core-mine Medical数据库预测干预DIRGs的中药,收集其性味归经信息.结果:共获得63个DIRGs,筛选出10个Hub基因(CD86、TLR2、TYROBP、CCR1、ITGB2、CCL2、CCL4、CSF1R、CXCR4、CTSS).富集分析结果显示,DIRGs的分子功能、生物学过程和信号通路与免疫调节密切相关.免疫细胞浸润分析结果显示,EAP中调节性T细胞、活化的树突状细胞、静息肥大细胞比例升高;AAP中记忆性B细胞、γδ T细胞、M0巨噬细胞、M2巨噬细胞比例升高.相关性分析结果显示,EAP中CD86与M2型巨噬细胞呈正相关;AAP中CD86、CTSS、CXCR4、CSF1R、ITGB2、TYROBP与M0巨噬细胞呈正相关,CCL4、CCL2与静息肥大细胞呈负相

作者：李兴渊；李晓辉；彭广操；王建茹

来源：中国免疫学杂志 2023 年 39卷 12期