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目的 利用网络药理学研究方法,探索康复新液治疗胃溃疡的机制.方法 通过文献检索收集康复新液的有效化学成分.基于PubChem、Super-PRED、OMIM、GeneCards等数据库,得到有效化学成分作用靶点及胃溃疡相关的疾病靶点,利用韦恩图得到康复新液治疗胃溃疡的相关靶点.利用蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)对靶点关系进行预测并通过Cytoscape软件中的"Cytohubba"插件进行关键基因的筛选.最后利用R语言"clusterprofiler"包对靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析预测康复新液治疗胃溃疡的作用机制.结果 通过文献检索共收集到12种康复新液的有效化学成分,基于各个数据库获得了 134个康复新液治疗胃溃疡相关靶点,根据PPI网络分析及"Cytohubba"插件筛选出 13个靶点,分别为:STAT3、HSP90AA1、MTOR、MMP9、EZH2、CXCR4、MMP2、PTGS2、TLR4、CDK2、PTPN11、GSK3B、PDGFRB.GO分析表明:靶基因在生物过程中主要集中在MAPK级联正调控、对氧气水平的反应、对氧化应激的反应、细胞对氧化应激的反应、细胞因子产生的正向调节等;KEGG分析表明:靶基因主要集中在JAK-STAT、PI3K-Akt、HIF-1、MAPK信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、T辅助细胞17细胞分化等.结论 康复新液对胃溃疡的治疗涉及多个靶点以及多

作者:薛丰富;寇继光

来源:中国医学工程 2023 年 31卷 12期

知识库介绍

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作者:
薛丰富;寇继光
来源:
中国医学工程 2023 年 31卷 12期
标签:
网络药理学 胃溃疡 康复新液 美洲大蠊 network pharmacology gastric ulcer KANGFUXIN liquid periplaneta americana
目的 利用网络药理学研究方法,探索康复新液治疗胃溃疡的机制.方法 通过文献检索收集康复新液的有效化学成分.基于PubChem、Super-PRED、OMIM、GeneCards等数据库,得到有效化学成分作用靶点及胃溃疡相关的疾病靶点,利用韦恩图得到康复新液治疗胃溃疡的相关靶点.利用蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)对靶点关系进行预测并通过Cytoscape软件中的"Cytohubba"插件进行关键基因的筛选.最后利用R语言"clusterprofiler"包对靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析预测康复新液治疗胃溃疡的作用机制.结果 通过文献检索共收集到12种康复新液的有效化学成分,基于各个数据库获得了 134个康复新液治疗胃溃疡相关靶点,根据PPI网络分析及"Cytohubba"插件筛选出 13个靶点,分别为:STAT3、HSP90AA1、MTOR、MMP9、EZH2、CXCR4、MMP2、PTGS2、TLR4、CDK2、PTPN11、GSK3B、PDGFRB.GO分析表明:靶基因在生物过程中主要集中在MAPK级联正调控、对氧气水平的反应、对氧化应激的反应、细胞对氧化应激的反应、细胞因子产生的正向调节等;KEGG分析表明:靶基因主要集中在JAK-STAT、PI3K-Akt、HIF-1、MAPK信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、T辅助细胞17细胞分化等.结论 康复新液对胃溃疡的治疗涉及多个靶点以及多

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