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目的 探讨TUC40-在人和小鼠心脏胚胎发育过程中是否发挥作用.方法 应用生物信息学网站NCBI、UCSC、Uniprot及软件Clustal、DNAMAN、MEGA 6等,对TUC40-及其编码片段uc.40-进行分析;采用链特异性逆转录实时定量聚合酶链反应检测TUC40-与其正义链产物Pbx1 mRNA在小鼠胚胎心脏发育关键时间点的表达谱.结果 Uc.40-于核苷酸序列、基因组位置及转录因子结合位点3个水平在人和小鼠具有保守性.TUC40-与Pbx1 mRNA在小鼠心脏胚胎发育过程中呈现负性趋势.结论 Uc.40-的多水平保守性提示了TUC40-功能的保守性.TUC40-可能是通过调控Pbx1,在人和小鼠的心脏胚胎发育中发挥作用.

作者:李慧娟;蒋犁;余章斌;韩树萍;刘雪华

来源:中国医学科学院学报 2016 年 38卷 1期

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作者:
李慧娟;蒋犁;余章斌;韩树萍;刘雪华
来源:
中国医学科学院学报 2016 年 38卷 1期
标签:
长链非编码RNA 生物信息学 保守性 表达谱 室间隔缺损 long non-coding RNA bioinformatics conservation expression profile ventricular septal defect
目的 探讨TUC40-在人和小鼠心脏胚胎发育过程中是否发挥作用.方法 应用生物信息学网站NCBI、UCSC、Uniprot及软件Clustal、DNAMAN、MEGA 6等,对TUC40-及其编码片段uc.40-进行分析;采用链特异性逆转录实时定量聚合酶链反应检测TUC40-与其正义链产物Pbx1 mRNA在小鼠胚胎心脏发育关键时间点的表达谱.结果 Uc.40-于核苷酸序列、基因组位置及转录因子结合位点3个水平在人和小鼠具有保守性.TUC40-与Pbx1 mRNA在小鼠心脏胚胎发育过程中呈现负性趋势.结论 Uc.40-的多水平保守性提示了TUC40-功能的保守性.TUC40-可能是通过调控Pbx1,在人和小鼠的心脏胚胎发育中发挥作用.

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