目的 本研究旨在基于生物信息学分析探讨ABCA3在非小细胞肺癌——肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中的临床意义和生物学功能.方法 基于癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA),提取LUAD中ABCA3表达和相应的临床信息.使用R4.2.2软件进行统计分析.采用Wilcoxon符号秩和检验比较TCGA LUAD队列中肿瘤组织与对照组之间ABCA3的表达,以及临床病理参数与ABCA3表达水平之间的关系.根据ABCA3表达的中位数,将TCGA LUAD患者分为高表达组和低表达组.使用survival包和survminer包分析ABC A 3与LUAD患者总生存(overall survival,OS)期和无进展生存(progression free survival,PFS)期的关系,并进行单因素和多因素Cox回归分析确定与LUAD预后相关的危险因素.使用rms包构建预测LUAD患者1年、2年和3年OS率的列线图模型.使用DESeq2包对高表达组和低表达组患者进行差异表达基因(differential expressed genes,DEGs)分析,并使用 clusterProfiler 包对 DEGs 进行基因本体(Gene Ontology,GO)数据库和基因组京都百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.利用CIBERSORT算法预测LU-AD肿瘤样本和正常样本中22种浸润性免疫细胞的丰度,并分析ABC A3表达与免疫浸润细胞和免疫检查点之间的相关性.结果 AB

作者：张萌萌；邵松；曹冰；潘蕾

来源：中国医学前沿杂志（电子版） 2024 年 16卷 1期