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目的分离珍稀濒危兰科药用铁皮石斛谷氨酸脱羧酶(GAD)基因并进行生物信息学和表达分析。方法采用 RT-PCR和 RACE技术获基因 cDNA全长;利用生物信息学软件分析蛋白理化性质、结构域和三维建模等分子特性;用 DNASTAR 6.0和 MEGA 4.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树分析;借助实时定量 PCR检测基因表达。结果分离到DoGAD基因,cDNA全长1795 bp,编码一条由498个氨基酸组成的多肽,分子量55.90 kD,等电点5.32;DoGAD蛋白不含跨膜域或信号肽,具有谷氨酸脱羧酶和磷酸吡哆醛依赖的脱羧酶结构域(17-443、37-381);DoGAD与植物 GADs蛋白一致性为69.5

作者:张岗;胡本祥;李依民;张大为;郭顺星

来源:中国医药生物技术 2014 年 5期

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作者:
张岗;胡本祥;李依民;张大为;郭顺星
来源:
中国医药生物技术 2014 年 5期
标签:
铁皮石斛 谷氨酸脱羧酶 γ-氨基丁酸 计算生物学 基因克隆 Dendrobium officinale Glutamate decarboxylase Gamma-aminobutyric acid Compatational biology Gene clone
目的分离珍稀濒危兰科药用铁皮石斛谷氨酸脱羧酶(GAD)基因并进行生物信息学和表达分析。方法采用 RT-PCR和 RACE技术获基因 cDNA全长;利用生物信息学软件分析蛋白理化性质、结构域和三维建模等分子特性;用 DNASTAR 6.0和 MEGA 4.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树分析;借助实时定量 PCR检测基因表达。结果分离到DoGAD基因,cDNA全长1795 bp,编码一条由498个氨基酸组成的多肽,分子量55.90 kD,等电点5.32;DoGAD蛋白不含跨膜域或信号肽,具有谷氨酸脱羧酶和磷酸吡哆醛依赖的脱羧酶结构域(17-443、37-381);DoGAD与植物 GADs蛋白一致性为69.5

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