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目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因组织表达(GTE)数据库探索长链非编码RNA(lncRNA)WAC反义RNA1(WAC-AS1)在乳腺癌中的生物学功能以及对乳腺癌预后的影响。方法:基于TCGA和GTE数据库的WAC-AS1表达数据,比较WAC-AS1在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达差异;以WAC-AS1表达中位值为标准,将乳腺癌患者分为WAC-AS1高表达和低表达2组,比较2组患者的OS、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存期(DSS)和DFS以及癌组织中浸润的免疫细胞差异;使用肿瘤体细胞突变检测工具VarScan分析WAC-AS1相关的基因突变;采用基因集差异分析(GSVA)以及基因集富集分析(GSEA)寻找WAC-AS1在乳腺癌中可能参与的信号通路;采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建乳腺癌预后的临床预测模型,并用受试者操作特征(ROC)曲线以及3年、5年OS的校准曲线分别评价模型的预测效能以及准确性。采用实时荧光定量PCR实验检测MCF-10A、MCF-7和MDA-MB-231细胞中WAC-AS1的表达。结果:(1)WAC-AS1在乳腺癌中相对正常组织呈明显高表达[4.17(3.91,4.41)比3.70(3.37,4.09),Z=3.880,P<0.001]。(2)WAC-AS1高表达与低表达组的中位OS分别为10年和17.2年,组间比较差异有统计学意义(HR=1.680,95

作者:汪彦阳;周远洋;魏雪菲;陶志嵩;龚海燕

来源:中华乳腺病杂志(电子版) 2023 年 17卷 4期

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作者:
汪彦阳;周远洋;魏雪菲;陶志嵩;龚海燕
来源:
中华乳腺病杂志(电子版) 2023 年 17卷 4期
标签:
乳腺肿瘤 预后 免疫 临床预测模型 WAC反义RNA1
目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因组织表达(GTE)数据库探索长链非编码RNA(lncRNA)WAC反义RNA1(WAC-AS1)在乳腺癌中的生物学功能以及对乳腺癌预后的影响。方法:基于TCGA和GTE数据库的WAC-AS1表达数据,比较WAC-AS1在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达差异;以WAC-AS1表达中位值为标准,将乳腺癌患者分为WAC-AS1高表达和低表达2组,比较2组患者的OS、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存期(DSS)和DFS以及癌组织中浸润的免疫细胞差异;使用肿瘤体细胞突变检测工具VarScan分析WAC-AS1相关的基因突变;采用基因集差异分析(GSVA)以及基因集富集分析(GSEA)寻找WAC-AS1在乳腺癌中可能参与的信号通路;采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建乳腺癌预后的临床预测模型,并用受试者操作特征(ROC)曲线以及3年、5年OS的校准曲线分别评价模型的预测效能以及准确性。采用实时荧光定量PCR实验检测MCF-10A、MCF-7和MDA-MB-231细胞中WAC-AS1的表达。结果:(1)WAC-AS1在乳腺癌中相对正常组织呈明显高表达[4.17(3.91,4.41)比3.70(3.37,4.09),Z=3.880,P<0.001]。(2)WAC-AS1高表达与低表达组的中位OS分别为10年和17.2年,组间比较差异有统计学意义(HR=1.680,95

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