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目的 了解手足口病样本中除肠道病毒外的其他病毒病原,并分析其分子特征与基因类型.方法 采用宏基因组学结合生物信息学的方法对1例手足口病患儿样本进行深度测序分析.结果 该病例为肠道病毒71型与札如病毒混合感染.反转录聚合酶链反应(RT-PCR)验证样本中札如病毒核酸为阳性,经组装拼接获得全基因组序列为7 429 bp,含有3个开放阅读框.序列进化分析表明,该株病毒与浙江株Hu/G1/Zhejiangl/China/2014的同源性最高为99.4％,属于札如病毒GⅠ基因型,是当前我国主要的感染型.结论 利用深度测序方法鉴定出手足口病样本混合感染病原为札如病毒,序列分析表明其为我国流行的优势毒株.该研究为今后我国手足口病和腹泻相关疾病的病原检测提供了参考依据,为了解我国札如病毒感染的分子特征提供了序列参考.
作者：王春花；黄威；周帅锋；于盼辉；段素霞；张益；高立冬；马学军
来源：中华实验和临床病毒学杂志 2017 年 31卷 1期
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