目的:使用生物信息学方法构建铁死亡相关微小RNA(miRNAs)-信使RNA(mRNAs)的调控网络并探讨其在骨关节炎(OA)中的分子作用机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载软骨相关数据集GSE175961和GSE1140007，利用生物信息学方法筛选铁死亡相关miRNAs和mRNAs，并进行富集分析、miRNA-mRNA网络构建以及诊断价值分析。最后采用荧光实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证关键基因表达，并采用独立样本
t检验比较其差异。
结果:GSE175961数据集中共筛选获得了15个差异表达miRNAs。使用TargetScan和miRDB数据库分别预测差异表达miRNAs的下游靶基因，共获得了5 115个共存的靶基因。与GSE1140007数据集中19个差异表达铁死亡基因取交集后共获得了4个下游铁死亡基因(PARP15、KLF2、CDKN1A、PDK4)。基于上述研究结果构建了由15个差异表达的miRNAs和4个下游铁死亡基因组成的miRNA-mRNA调控网络。进一步富集分析表明，4个下游铁死亡基因与多种生物学功能和信号途径有关，如脂肪酸代谢、细胞周期调控、FOXO信号途径以及P53信号途径等。受试者工作曲线分析表明，4个下游铁死亡基因具有良好的诊断价值。此外，使用外部数据集证实，CDKN1A和PDK4在OA软骨组织中表达降低。而列线图表明，OA发生率随CDKN1A和PDK4表达降
作者：孙红；陈坤浩；彭国璇；熊治林；李钟辉；邓进；杨华
来源：中华实验外科杂志 2024 年 41卷 1期
