目的:通过生物信息学分析筛选脓毒症诱导急性肺损伤（ALI）的关键基因。方法:从基因表达谱（GEO）数据库中下载GSE10474数据集，该数据集包含13例脓毒症ALI患者样本（ALI组）和21例脓毒症患者样本（脓毒症组）基因数据。使用limma包筛选两组样本的差异表达基因，并对筛选出的差异表达基因进行基因本体论（GO）功能分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过STRING数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络并确定前10位hub基因。结果:从GSE10474数据集中共筛选出115个差异表达基因，其中65个上调基因，50个下调基因。GO分析显示，生物过程的基因主要富集在金属离子稳态、氧化应激、电离辐射等；细胞组分主要富集在液泡膜、高尔基体膜、内质网膜、溶酶体膜等生物膜；这些基因主要与生物跨膜、泛素结合酶活性、蛋白络氨酸、丝氨酸和苏氨酸激酶结合蛋白活性以及蛋白激酶抑制活性等分子功能相关。KEGG富集分析显示，差异表达基因主要富集在磷脂酶信号通路、胰岛素信号通路、T细胞介导的免疫反应以及免疫相关的信号通路。PPI网络图筛选出了前10位hub基因，分别为CD4、CD74、髓细胞核分化抗原（MNDA）、髓细胞触发受体1（TREM1）、人白细胞抗原DRA（HLA-DRA）、细胞附着蛋白1相互作用蛋白（CYTIP）、凝
作者：梁哲浩；方明笋；胡弘毅；陶涛；徐孝平；孙华琴
来源：中华危重症医学杂志（电子版） 2022 年 15卷 5期
