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目的研究胃癌原发灶和转移淋巴结组织间基因组DNA甲基化程度的差异以及寻找胃癌淋巴转移抑制基因.方法应用甲基化CpG岛扩增(MCA)方法富集甲基化的基因组DNA序列,以转移淋巴结MCA产物为检测子,原发灶MCA产物为驱赶子,进行代表性差异显示分析(RDA).将获得的甲基化差异片段克隆、测序,获得碱基序列,用生物信息学进行分析.结果获得19个差异序列,分布于5′端,外显子,内含子及3′端.其中KL59位于9p21,为p16基因的第一外显子内;KL22位于PTPRG基因启动子区.以KL22作探针与驱赶子、检测子及3轮RDA产物杂交,除驱赶子外都有杂交信号.结论胃癌原发灶与转移淋巴结组织间DNA甲基化存在差异,MCA-RDA方法为一种较好的分析方法.

作者:王剑峰;戴冬秋

来源:中华医学杂志 2006 年 86卷 8期

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作者:
王剑峰;戴冬秋
来源:
中华医学杂志 2006 年 86卷 8期
标签:
胃肿瘤 淋巴转移 DNA甲基化 基因 抑制 肿瘤
目的研究胃癌原发灶和转移淋巴结组织间基因组DNA甲基化程度的差异以及寻找胃癌淋巴转移抑制基因.方法应用甲基化CpG岛扩增(MCA)方法富集甲基化的基因组DNA序列,以转移淋巴结MCA产物为检测子,原发灶MCA产物为驱赶子,进行代表性差异显示分析(RDA).将获得的甲基化差异片段克隆、测序,获得碱基序列,用生物信息学进行分析.结果获得19个差异序列,分布于5′端,外显子,内含子及3′端.其中KL59位于9p21,为p16基因的第一外显子内;KL22位于PTPRG基因启动子区.以KL22作探针与驱赶子、检测子及3轮RDA产物杂交,除驱赶子外都有杂交信号.结论胃癌原发灶与转移淋巴结组织间DNA甲基化存在差异,MCA-RDA方法为一种较好的分析方法.

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