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目的 分析S期激酶相关蛋白1(SKP1)和S期激酶相关蛋白2(SKP2)表达水平对肾透明细胞癌、肾嫌色细胞癌、肾乳头状细胞癌这3种肾癌患者预后的预测作用.方法 使用TCGA数据库中肾透明细胞癌、肾嫌色细胞癌、肾乳头状细胞癌样本进行SKP1和SKP2表达水平及其甲基化与预后相关性分析、不同表达水平间基因突变情况分析.采用Metascape数据库分析SKP2在这3种肾癌中共表达基因功能富集情况及蛋白质相互作用情况.结果 与正常组织比较,SKP1表达水平在这3种肾癌中均显著降低,SKP2在肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌中显著升高.在这3种肾癌中SKP2高表达者预后均较差,AUC值和一致性指数提示预测准确性稳定.肾癌中多个甲基化位点与SKP1或SKP2表达水平及预后显著相关.肾透明细胞癌中SKP1和SKP2突变占14%.KMT2C、HERC2、PRKDC、SETD2和HMCN1基因突变与SKP1或SKP2表达水平高低相关.肾癌中SKP2共表达基因富集部分与免疫应答调节相关.结论 SKP2及其甲基化可以预测肾癌预后.肾癌中SKP1、SKP2表达高低与KMT2C、HERC2、PRKDC、SETD2和HMCN1等基因突变相关,并受多种甲基化位点影响.

作者:杨伟芳;杨海华;冉刚;皮文虎;王学全

来源:浙江医学 2022 年 44卷 19期

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作者:
杨伟芳;杨海华;冉刚;皮文虎;王学全
来源:
浙江医学 2022 年 44卷 19期
标签:
肾癌 S期激酶相关蛋白1 S期激酶相关蛋白2预后
目的 分析S期激酶相关蛋白1(SKP1)和S期激酶相关蛋白2(SKP2)表达水平对肾透明细胞癌、肾嫌色细胞癌、肾乳头状细胞癌这3种肾癌患者预后的预测作用.方法 使用TCGA数据库中肾透明细胞癌、肾嫌色细胞癌、肾乳头状细胞癌样本进行SKP1和SKP2表达水平及其甲基化与预后相关性分析、不同表达水平间基因突变情况分析.采用Metascape数据库分析SKP2在这3种肾癌中共表达基因功能富集情况及蛋白质相互作用情况.结果 与正常组织比较,SKP1表达水平在这3种肾癌中均显著降低,SKP2在肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌中显著升高.在这3种肾癌中SKP2高表达者预后均较差,AUC值和一致性指数提示预测准确性稳定.肾癌中多个甲基化位点与SKP1或SKP2表达水平及预后显著相关.肾透明细胞癌中SKP1和SKP2突变占14%.KMT2C、HERC2、PRKDC、SETD2和HMCN1基因突变与SKP1或SKP2表达水平高低相关.肾癌中SKP2共表达基因富集部分与免疫应答调节相关.结论 SKP2及其甲基化可以预测肾癌预后.肾癌中SKP1、SKP2表达高低与KMT2C、HERC2、PRKDC、SETD2和HMCN1等基因突变相关,并受多种甲基化位点影响.

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