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[目的]基于网络药理预测祛浊通痹方(Quzhuo Tongbi,QZTB)治疗肥胖的有效成分和潜在机制,并采用肥胖模型小鼠验证其效果.[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选QZTB有效成分及靶点,检索DrugBank、人类基因组注释数据库(Human Genome Annotation Database,GeneCards)和在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库收集肥胖的相关靶点,利用Venny 2.1在线平台筛选QZTB治疗肥胖的交集靶点,并制作韦恩图,根据STRING 11.5数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图,借助网络拓扑分析(Cytoscape network centrality analysis,CytoNCA)插件筛选QZTB治疗肥胖的核心靶点.利用Cytoscape 3.8.2软件建立"中药-成分-靶点-疾病"模型,筛选QZTB治疗肥胖的有效成分,并基于Metascape在线数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomics,KEGG)通路富集分析,通过Python对结果进行可视化.将C57BL/6雄性小鼠随机分为空白组、模型组和QZTB组,通过高脂饲料诱导肥胖模型,灌胃给药10周后分离肝脏组织进行病理

作者:方珍珍;胡雨桐;郑妍;周子尊;吕惠卿

来源:浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 10期

知识库介绍

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作者:
方珍珍;胡雨桐;郑妍;周子尊;吕惠卿
来源:
浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 10期
标签:
网络药理学 祛浊通痹方 肥胖 基因靶点 作用机制 实验验证 network pharmacology Quzhuo Tongbi Formula obesity gene targets mechanism experimental verification
[目的]基于网络药理预测祛浊通痹方(Quzhuo Tongbi,QZTB)治疗肥胖的有效成分和潜在机制,并采用肥胖模型小鼠验证其效果.[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选QZTB有效成分及靶点,检索DrugBank、人类基因组注释数据库(Human Genome Annotation Database,GeneCards)和在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库收集肥胖的相关靶点,利用Venny 2.1在线平台筛选QZTB治疗肥胖的交集靶点,并制作韦恩图,根据STRING 11.5数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图,借助网络拓扑分析(Cytoscape network centrality analysis,CytoNCA)插件筛选QZTB治疗肥胖的核心靶点.利用Cytoscape 3.8.2软件建立"中药-成分-靶点-疾病"模型,筛选QZTB治疗肥胖的有效成分,并基于Metascape在线数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomics,KEGG)通路富集分析,通过Python对结果进行可视化.将C57BL/6雄性小鼠随机分为空白组、模型组和QZTB组,通过高脂饲料诱导肥胖模型,灌胃给药10周后分离肝脏组织进行病理

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