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目的 研究武汉市耐多药结核分枝杆菌的耐药基因突变特点,为武汉市耐药结核病的分子诊断提供依据.方法 选取2017年武汉市肺科医院登记的耐多药肺结核病例的分离菌株,进行全基因测序,获得各菌株独属的谱系、亚型和耐药基因突变,分析不同主要耐药突变类型特点及其与谱系或亚型间的相关性.结果 149株中,常用抗结核药物耐药相关基因主要突变类型分别为katGSer315Thr(65.77%,异烟肼)、ropBSer450Leu(62.42%,利福平)、rpsL Lys43Arg(46.31%,链霉素)、embBMet306Val(20.13%,乙胺丁醇)、pncA-11 T>C(3.36%,吡嗪酰胺)、gyrA Ala90Val(10.07%,氟喹诺酮)、rrs-1401 A>G(4.70%,二线注射类)、fabG-15 C>T(14.09%,乙硫异烟胺)、folC Ile43Thr(3.36%,对氨基水杨酸).发现9株ahpC-OxyR突变(异烟肼耐药补偿性突变),5株rpoC基因突变(利福平耐药补偿性突变).L4型菌株的embB Met306Ile突变频率大于L2,rpsLLys43Arg突变频率小于L2(P<0.05),其他位点突变频率的差异无统计学意义.古典型thyA His75Asn突变频率大于现代型(P<0.05).结论 武汉市耐多药结核菌株突变存在多样性,宜采用全基因测序方法进行检测,如采用靶向分子检测方法,则可能会存在漏检.同时,也发现多种耐药突变类型与菌株谱系或亚型相关.

作者:邬俊;陈军;周美兰;张正斌;王甜甜;余爱平;段琼红

来源:公共卫生与预防医学 2022 年 33卷 6期

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作者:
邬俊;陈军;周美兰;张正斌;王甜甜;余爱平;段琼红
来源:
公共卫生与预防医学 2022 年 33卷 6期
标签:
结核分枝杆菌 全基因组测序 耐药性
目的 研究武汉市耐多药结核分枝杆菌的耐药基因突变特点,为武汉市耐药结核病的分子诊断提供依据.方法 选取2017年武汉市肺科医院登记的耐多药肺结核病例的分离菌株,进行全基因测序,获得各菌株独属的谱系、亚型和耐药基因突变,分析不同主要耐药突变类型特点及其与谱系或亚型间的相关性.结果 149株中,常用抗结核药物耐药相关基因主要突变类型分别为katGSer315Thr(65.77%,异烟肼)、ropBSer450Leu(62.42%,利福平)、rpsL Lys43Arg(46.31%,链霉素)、embBMet306Val(20.13%,乙胺丁醇)、pncA-11 T>C(3.36%,吡嗪酰胺)、gyrA Ala90Val(10.07%,氟喹诺酮)、rrs-1401 A>G(4.70%,二线注射类)、fabG-15 C>T(14.09%,乙硫异烟胺)、folC Ile43Thr(3.36%,对氨基水杨酸).发现9株ahpC-OxyR突变(异烟肼耐药补偿性突变),5株rpoC基因突变(利福平耐药补偿性突变).L4型菌株的embB Met306Ile突变频率大于L2,rpsLLys43Arg突变频率小于L2(P<0.05),其他位点突变频率的差异无统计学意义.古典型thyA His75Asn突变频率大于现代型(P<0.05).结论 武汉市耐多药结核菌株突变存在多样性,宜采用全基因测序方法进行检测,如采用靶向分子检测方法,则可能会存在漏检.同时,也发现多种耐药突变类型与菌株谱系或亚型相关.

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