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目的:通过生物信息学方法分析SMARCA1基因在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达和临床意义。方法:应用HPA、TIMER和UALCAN数据库分析SMARCA1在NSCLC和正常肺组织中的表达差异。以GEPIA、TIMER数据库样本中SMARCA1表达的中位数作为分界点,分为高表达SMARCA1组和低表达SMARCA1组,探索SMARCA1表达水平与NSCLC患者预后关系。采用UALCAN数据库分析SMARCA1基因在肺腺癌不同临床亚组的表达情况。cBioPortal数据库分析SMARCA1在NSCLC中的遗传突变信息。通过STRING数据库分析SMARCA1潜在蛋白相互作用。运用TISIDB数据库探索SMARCA1表达与NSCLC肿瘤免疫浸润的关系。结果:TIMER和UALCAN数据库分析表明SMARCA1在肺腺癌中表达均高于正常组织,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。GEPIA和TIMER数据库中高表达SMARCA1的肺腺癌患者总生存期均短于低表达患者,差异均有统计学意义( HR=1.50, P=0.009; HR=1.12, P=0.044);2组肺鳞癌患者的总生存期比较差异均无统计学意义(均 P>0.05)。不同性别、年龄、淋巴结转移和TP53突变情况的肺腺癌患者SMARCA1表达差异均无统计学意义(均 P>0.05)。cBioPortal数据库分析提示507例肺腺癌患者中23例携带SMARCA1基因突变,主要为错义突变、剪

作者:何梦钰;陈玲;解卫平

来源:国际呼吸杂志 2023 年 43卷 9期

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作者:
何梦钰;陈玲;解卫平
来源:
国际呼吸杂志 2023 年 43卷 9期
标签:
癌,非小细胞肺 预后 SMARCA1基因 生物信息分析 Carcinoma, non-small-cell lung Prognosis SMARCA1 gene Bioinformatics analysis
目的:通过生物信息学方法分析SMARCA1基因在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达和临床意义。方法:应用HPA、TIMER和UALCAN数据库分析SMARCA1在NSCLC和正常肺组织中的表达差异。以GEPIA、TIMER数据库样本中SMARCA1表达的中位数作为分界点,分为高表达SMARCA1组和低表达SMARCA1组,探索SMARCA1表达水平与NSCLC患者预后关系。采用UALCAN数据库分析SMARCA1基因在肺腺癌不同临床亚组的表达情况。cBioPortal数据库分析SMARCA1在NSCLC中的遗传突变信息。通过STRING数据库分析SMARCA1潜在蛋白相互作用。运用TISIDB数据库探索SMARCA1表达与NSCLC肿瘤免疫浸润的关系。结果:TIMER和UALCAN数据库分析表明SMARCA1在肺腺癌中表达均高于正常组织,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。GEPIA和TIMER数据库中高表达SMARCA1的肺腺癌患者总生存期均短于低表达患者,差异均有统计学意义( HR=1.50, P=0.009; HR=1.12, P=0.044);2组肺鳞癌患者的总生存期比较差异均无统计学意义(均 P>0.05)。不同性别、年龄、淋巴结转移和TP53突变情况的肺腺癌患者SMARCA1表达差异均无统计学意义(均 P>0.05)。cBioPortal数据库分析提示507例肺腺癌患者中23例携带SMARCA1基因突变,主要为错义突变、剪

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