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目的:对经胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者的外周血进行转录组测序,利用生物信息学分析并验证差异显著的miRNA,探究治疗促进创面愈合可能的机制.方法:通过转录组测序,获取了miRNA的表达数据,随后进行差异表达、靶基因预测和功能富集分析,最后进行临床样本的实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证.结果:经过差异表达分析,发现差异表达显著的hsa-miR-103a-3p上调.预测得其109个靶基因主要与发芽血管的调控,大分子代谢过程负调控和细胞蛋白修饰过程等生物学过程相关,以及AMPK信号通路相关.而靶基因中经MNC算法获得前10的核心基因为AGO1、CDK6、TN-RC6B、DICER1、CAPZA2、KIF23、KIF5A、MTMR3、MTMR4、PIK3R1;验证临床样本结果得出,TTT 组的 hsa-miR-103a-3p相对表达量比对照治疗组相比升高3.7倍(P<0.001).结论:hsa-miR-103a-3p在胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者过程中表达上升,可能是手术治疗促进伤口愈合和血管生成的效应miRNA之一.

作者:苏宏杰;花奇凯

来源:广西医科大学学报 2022 年 39卷 5期

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作者:
苏宏杰;花奇凯
来源:
广西医科大学学报 2022 年 39卷 5期
标签:
转录组测序 胫骨横向骨搬移术 生物信息学分析 伤口愈合 糖尿病足
目的:对经胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者的外周血进行转录组测序,利用生物信息学分析并验证差异显著的miRNA,探究治疗促进创面愈合可能的机制.方法:通过转录组测序,获取了miRNA的表达数据,随后进行差异表达、靶基因预测和功能富集分析,最后进行临床样本的实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证.结果:经过差异表达分析,发现差异表达显著的hsa-miR-103a-3p上调.预测得其109个靶基因主要与发芽血管的调控,大分子代谢过程负调控和细胞蛋白修饰过程等生物学过程相关,以及AMPK信号通路相关.而靶基因中经MNC算法获得前10的核心基因为AGO1、CDK6、TN-RC6B、DICER1、CAPZA2、KIF23、KIF5A、MTMR3、MTMR4、PIK3R1;验证临床样本结果得出,TTT 组的 hsa-miR-103a-3p相对表达量比对照治疗组相比升高3.7倍(P<0.001).结论:hsa-miR-103a-3p在胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者过程中表达上升,可能是手术治疗促进伤口愈合和血管生成的效应miRNA之一.

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