目的 基于生物信息学方法分析药物治疗骨关节炎的潜在基因靶点.方法 从基因表达综合数据库筛选出符合条件的微阵列芯片GSE41038、GSE55235、GSE55457、GSE82107,使用R语言软件筛选出差异表达基因(DEGs).利用DAVID数据库进行DEGs的基因本体论(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件制作蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并运用cytoHubba插件分析PPI网络中的中枢模块.基于DRUGBANK数据库与药物-基因相互作用数据库确定骨关节炎常用治疗药物及其靶基因,并将靶基因与中枢模块的关键基因取交集,选取4 例骨关节炎患者(实验组)和4 例关节创伤患者(对照组)的滑膜组织进行实时荧光定量PCR验证.结果 共筛选出111 个DEGs,其中表达上调基因55 个、表达下调基因56 个.DEGs的生物学过程主要与细胞黏附、免疫反应、凋亡过程的正向调控有关,细胞组分主要富集在细胞外区域、浆膜、细胞外间质等,分子功能主要富集在转录因子活性与特异性序列DNA结合、蛋白质同质化活性等方面;DEGs通过白细胞介素17 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等信号通路参与骨关节炎滑膜炎症发展.PPI网络的中枢模块包含11 个关键基因.共筛选出50 种治疗骨关节炎的常用药物(塞来昔布、吲哚美辛、曲马
作者：黄悦；曾平；刘金富；陈莉华；陆冠宇；熊波；陈财
来源：广西医学 2023 年 45卷 8期
