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中国树花是广布于北半球的一种地衣,具有抗病毒、抗菌、抗氧化、抗肿瘤、抗炎和治疗糖尿病等生物活性.本研究首次对中国树花Ramalina sinensis的线粒体基因组进行测序、组装和注释,结果表明其线粒体基因组是一个长度为 38 265 bp的环状分子,共编码 42 个基因(15 个蛋白质编码基因(PCGs)、2 个rRNA基因和 25 个tRNA基因),碱基组成具有明显AT偏好性,其中 24 个tRNA被成功预测为典型三叶草结构.密码子偏好性分析显示该线粒体基因组对A/U结尾的密码子具有明显偏好性.树花科地衣共线性分析没有发现大面积的基因重排现象.与间枝树花R.intermedia的线粒体基因组比较分析显示这 2 个物种有着较为亲密的适应性进化关系.15 个PCGs的Ka/Ks值各不相同,说明这些基因正在接受不同的选择压力.系统发育分析表明中国树花与间枝树花的亲缘关系很紧密.本研究为树花属的资源保护、系统进化以及遗传多样性研究提供基础数据.

作者:热衣木·马木提;方津津;古丽米热·艾尼瓦尔

来源:菌物学报 2023 年 42卷 6期

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作者:
热衣木·马木提;方津津;古丽米热·艾尼瓦尔
来源:
菌物学报 2023 年 42卷 6期
标签:
中国树花 线粒体基因组 系统发育 Ramalina sinensis mitochondrial genome phylogeny
中国树花是广布于北半球的一种地衣,具有抗病毒、抗菌、抗氧化、抗肿瘤、抗炎和治疗糖尿病等生物活性.本研究首次对中国树花Ramalina sinensis的线粒体基因组进行测序、组装和注释,结果表明其线粒体基因组是一个长度为 38 265 bp的环状分子,共编码 42 个基因(15 个蛋白质编码基因(PCGs)、2 个rRNA基因和 25 个tRNA基因),碱基组成具有明显AT偏好性,其中 24 个tRNA被成功预测为典型三叶草结构.密码子偏好性分析显示该线粒体基因组对A/U结尾的密码子具有明显偏好性.树花科地衣共线性分析没有发现大面积的基因重排现象.与间枝树花R.intermedia的线粒体基因组比较分析显示这 2 个物种有着较为亲密的适应性进化关系.15 个PCGs的Ka/Ks值各不相同,说明这些基因正在接受不同的选择压力.系统发育分析表明中国树花与间枝树花的亲缘关系很紧密.本研究为树花属的资源保护、系统进化以及遗传多样性研究提供基础数据.

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