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目的 鉴定心房颤动(atrial fibrillation,AF)患者的炎症相关基因,并探讨这些基因与浸润免疫细胞在AF的发生发展过程中可能的作用和机制.方法 通过一系列的生物信息学分析结合机器学习算法识别AF的生物标志物,使用受试者操作特性曲线(receiver operating characteristic,ROC)验证关键基因的预测及诊断价值,采用Spearman 相关分析明确关键基因与浸润免疫细胞的相关性.结果 筛选出 593 个差异基因[|log2(fold change,FC)|>1,P<0.05],7 种免疫细胞亚型(P<0.05),获得 190 个免疫相关差异基因,识别出 3 个生物标志物(IGF1、PTGS2 和PPARG),相关性分析结果显示3 个标志物与浸润免疫细胞显著相关(P<0.05).结论 IGF1、PTGS2 和PPARG是AF的炎症相关基因,推测其与免疫细胞浸润过程和途径密切相关.

作者:杨曼;赵兴安;葛芸娜;秦娟;王玺雅;陶四明

来源:昆明医科大学学报 2024 年 45卷 3期

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作者:
杨曼;赵兴安;葛芸娜;秦娟;王玺雅;陶四明
来源:
昆明医科大学学报 2024 年 45卷 3期
标签:
心房颤动 生物信息学分析 免疫浸润 炎症反应 生物标志物 Atrial fibrillation Bioinformatics analysis Immune infiltration Inflammatory response Biomarkers
目的 鉴定心房颤动(atrial fibrillation,AF)患者的炎症相关基因,并探讨这些基因与浸润免疫细胞在AF的发生发展过程中可能的作用和机制.方法 通过一系列的生物信息学分析结合机器学习算法识别AF的生物标志物,使用受试者操作特性曲线(receiver operating characteristic,ROC)验证关键基因的预测及诊断价值,采用Spearman 相关分析明确关键基因与浸润免疫细胞的相关性.结果 筛选出 593 个差异基因[|log2(fold change,FC)|>1,P<0.05],7 种免疫细胞亚型(P<0.05),获得 190 个免疫相关差异基因,识别出 3 个生物标志物(IGF1、PTGS2 和PPARG),相关性分析结果显示3 个标志物与浸润免疫细胞显著相关(P<0.05).结论 IGF1、PTGS2 和PPARG是AF的炎症相关基因,推测其与免疫细胞浸润过程和途径密切相关.

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