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目的:探寻幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和进化分型与胃癌的相关性.方法:选取2011-2018年青岛市市立医院保存的150株Hp(胃癌来源59株和胃炎来源91株),运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法扩增fur基因,并进行一代测序及SNP分析.通过NCBI数据库下载226株东亚亚群Hp 菌株fur基因序列,应用MEGA 5.0软件分析SNP并构建fur基因Neighbour-Joining系统进化树,建立进化分型.结果:98.7%(148/150)Hp菌株fur 基因PCR扩增阳性.序列分析发现fur基因351位点存在碱基A→G的同义SNP(SNPA351G),胃癌来源的菌株中G等位基因的变异频率明显高于胃炎来源的菌株,差异有统计学意义(x2=5.161,P=0.023);携带该等位基因的菌株发生胃癌风险明显升高(OR=2.4).在东亚Hp fur基因的Neighbour-Joining系统进化树中,依据进化距离将东亚Hp菌株分为Ⅰ型和Ⅱ型两个亚型,fur基因进化Ⅰ型中的胃癌来源Hp菌株比例明显高于Ⅱ型,差异有统计学意义(x2=41.8,P=9.9×10-11);感染furⅠ型Hp的患者发生胃癌的风险显著升高(OR=4.7).结论:携带fur SNPA351G的Hp菌株导致胃癌发生风险显著升高,fur基因进化 Ⅰ型与胃癌发生风险具

作者:魏毅;梁淑贞;张秋月;王莉莉;董全江

来源:现代生物医学进展 2024 年 24卷 2期

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作者:
魏毅;梁淑贞;张秋月;王莉莉;董全江
来源:
现代生物医学进展 2024 年 24卷 2期
标签:
幽门螺杆菌 铁摄取调节蛋白 单核苷酸多态性 进化 胃癌 Helicobacter pylori Ferric uptake regulator Single nucleotide polymorphism Evolution Gastric cancer
目的:探寻幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和进化分型与胃癌的相关性.方法:选取2011-2018年青岛市市立医院保存的150株Hp(胃癌来源59株和胃炎来源91株),运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法扩增fur基因,并进行一代测序及SNP分析.通过NCBI数据库下载226株东亚亚群Hp 菌株fur基因序列,应用MEGA 5.0软件分析SNP并构建fur基因Neighbour-Joining系统进化树,建立进化分型.结果:98.7%(148/150)Hp菌株fur 基因PCR扩增阳性.序列分析发现fur基因351位点存在碱基A→G的同义SNP(SNPA351G),胃癌来源的菌株中G等位基因的变异频率明显高于胃炎来源的菌株,差异有统计学意义(x2=5.161,P=0.023);携带该等位基因的菌株发生胃癌风险明显升高(OR=2.4).在东亚Hp fur基因的Neighbour-Joining系统进化树中,依据进化距离将东亚Hp菌株分为Ⅰ型和Ⅱ型两个亚型,fur基因进化Ⅰ型中的胃癌来源Hp菌株比例明显高于Ⅱ型,差异有统计学意义(x2=41.8,P=9.9×10-11);感染furⅠ型Hp的患者发生胃癌的风险显著升高(OR=4.7).结论:携带fur SNPA351G的Hp菌株导致胃癌发生风险显著升高,fur基因进化 Ⅰ型与胃癌发生风险具

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