丙酮酸脱氢酶 E1 组分 β 亚基-1(pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta-1,PDHB-1)基因是编码丙酮酸脱氢酶复合物E1 酶β亚基的基因,在果实酸度积累过程中具有重要作用.为了探究苹果(Malus domestica L.)PDHB-1家族的进化特征及其在不同酸含量苹果中的表达情况,本研究利用NCBI、Pfam等数据库和ClustalX、MEGA、TBtools等软件进行生物信息学分析,通过结合可滴定酸含量测定与实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析,获得该家族基因在'艾斯达'和'成纪 1 号'2 个不同酸含量的苹果中的表达情况.PDHB-1家族主要定位于叶绿体、细胞质和线粒体中,α-螺旋和不规则卷曲是该家族二级结构形成的主要因素.组织特异性表达谱显示大部分成员的表达量在果实中高于其他组织.qRT-PCR 结果表明,大部分成员其表达量变化趋势与可滴定酸含量变化趋势一致,在果皮中,有 14 个成员的表达水平在酸含量较高的'艾斯达'苹果中显著高于酸含量较低的'成纪 1 号',其中MdPDHB1-15差异最显著;在果肉中,17 个成员的表达水平在'艾斯达'苹果中显著高于'成纪 1 号',MdPDHB1-01表达量最高.预测苹果PDHB-1基因家族在苹果果实酸度积累过程中有重要调控作用.
作者：杨菁华；高举；李文芳；刘骥；霍嘉兴；任振硕；李龙；陈佰鸿；毛娟；马宗桓
来源：生物工程学报 2023 年 39卷 12期
