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为分析FASLG的序列特征,结构特征及与受体FAS的结合位点,为后续研究作用机制提供理论基础和实验思路,从NCBI蛋白质数据库中获取FASLG的序列信息,并使用生物信息学软件ProtParam、 ProtScale、 SignalP 4.1、TMHMM Server v.2.0、ClustalX、SWISS-MODEL和AutoDock等进行序列分析。结果表明:FASLG序列全长为281个氨基酸,偏碱性,为不稳定的亲水性蛋白;为跨膜蛋白,不含信号肽;有一个FAS受体结合域。 FASLG的三维结构包含74个α螺旋,20个β折叠,56个延展片段,其余131个则全为无规则卷曲。 FASLG蛋白通过15个氨基酸与其受体FAS蛋白相互耦合,从而形成FAS/FASLG信号通路来诱导凋亡。可见得到的FASLG的序列特征、结构及受体结合位点,将对后续研究FAS/FASLG信号通路及miR-21和FASLG在结肠癌细胞中的作用提供新思路和方向。

作者:麦秀英;周曼;李萍;徐柳

来源:生物学杂志 2016 年 33卷 1期

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作者:
麦秀英;周曼;李萍;徐柳
来源:
生物学杂志 2016 年 33卷 1期
标签:
FASLG 生物信息学 分子对接 FASLG bioinformatics molecular docking
为分析FASLG的序列特征,结构特征及与受体FAS的结合位点,为后续研究作用机制提供理论基础和实验思路,从NCBI蛋白质数据库中获取FASLG的序列信息,并使用生物信息学软件ProtParam、 ProtScale、 SignalP 4.1、TMHMM Server v.2.0、ClustalX、SWISS-MODEL和AutoDock等进行序列分析。结果表明:FASLG序列全长为281个氨基酸,偏碱性,为不稳定的亲水性蛋白;为跨膜蛋白,不含信号肽;有一个FAS受体结合域。 FASLG的三维结构包含74个α螺旋,20个β折叠,56个延展片段,其余131个则全为无规则卷曲。 FASLG蛋白通过15个氨基酸与其受体FAS蛋白相互耦合,从而形成FAS/FASLG信号通路来诱导凋亡。可见得到的FASLG的序列特征、结构及受体结合位点,将对后续研究FAS/FASLG信号通路及miR-21和FASLG在结肠癌细胞中的作用提供新思路和方向。

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