目的 探讨肿瘤突变负荷(TMB)在评估非小细胞肺癌(NSCLC)免疫治疗预后中的价值以及TMB与免疫浸润之间的关系.方法 从TCGA数据库中分别下载肺腺癌(LUAD)及肺鳞癌(LUSC)患者体细胞基因突变数据、转录组数据及临床数据.根据突变数据计算TMB评分,并根据训练计算出最佳TMB阈值,将患者分为低TMB和高TMB组.分析低TMB组和高TMB组之间差异表达基因(DEGs)、免疫细胞浸润和生存情况.通过GEPIA在线数据库查询了肺癌组织中的基因表达.结果 从TCGA获得了641 例肺腺癌(LUAD)和506 例肺鳞癌(LUSC)患者的样本信息,高、低TMB组的生存分析结果表明,高TMB组患者的生存率优于低TMB组患者.研究中共鉴定了 756 个DEGs,基因集富集分析(GSEA)显示,低TMB组的DEGs富集于免疫相关途径.在获得的差异表达基因中,借助ImmPort数据库筛选出15 个免疫相关的关键基因,包括5 个预后相关基因(CD274、PDCD1、CTLA4、LAG3、TIGIT).PDCD1、CTLA4、LAG3、TIGIT在肺癌组织中的表达无差异,CD274 在肺癌组织中的表达有差异.免疫浸润分析发现CD8+T细胞、激活期记忆CD4+T细胞、M1 巨噬细胞在高TMB组中浸润高于低TMB组,同时CXCL17 高表达是TMB与免疫浸润预后好的独立基因.结论 高TMB的LUAD患者的生存率优于低TMB的LUAD患者,可能与 CD8+T细胞、激活期记忆CD
作者：谢琛；许晨；陈淑慧；李俊玉；张怀文
来源：实用癌症杂志 2023 年 38卷 12期
