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[目的]通过气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)鉴定丁香挥发油的成分,生物信息学预测其可能作用机制.[方法]GC-MS分析成分后,使用SwissADME平台对活性成分进行筛选,通过Swiss和GeneCards数据库获取这些活性成分与疾病相关的靶点,再通过Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,采用String平台、Cytoscape软件构建靶点蛋白互作(PPI)网络,筛选关键靶点,将核心靶点导入DAVID数据库完成功能富集(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,采用GEO芯片进行核心靶点的外部验证和ROC分析,最后利用AutoDock软件进行分子对接验证.[结果]从丁香挥发油中共鉴定出 10 个主要成分,且均满足"类药五原则".预测到丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、酪氨酸蛋白激酶(SRC)、胱天蛋白酶 3(CASP3)等关键靶点,外部验证结果显示6个关键靶点表达均具有差异,TNF具有诊断价值.富集分析得到了 117个生物过程和 114 条信号通路.分子对接实验显示,大多数活性成分与其关键靶点具有良好的结合能力.[结论]丁香挥发油可能通过其中的活性成分如丁香酚等以及关键靶点如AKT1 等来调控信号传导、蛋白质磷酸化与细胞分化等多个生物学过程,从而协同发挥防治银屑病的作用.

作者:刘国鑫;于佳欣;张向阳;刘贺;王炎松;沈景辉;李淑贤

来源:天津中医药 2024 年 41卷 5期

知识库介绍

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作者:
刘国鑫;于佳欣;张向阳;刘贺;王炎松;沈景辉;李淑贤
来源:
天津中医药 2024 年 41卷 5期
标签:
丁香 挥发油 银屑病 活性成分 作用机制 GC-MS 生物信息学 Caryophylli Flos volatile oil psoriasis active ingredient mechanism of action GC-MS bioinformatics
[目的]通过气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)鉴定丁香挥发油的成分,生物信息学预测其可能作用机制.[方法]GC-MS分析成分后,使用SwissADME平台对活性成分进行筛选,通过Swiss和GeneCards数据库获取这些活性成分与疾病相关的靶点,再通过Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,采用String平台、Cytoscape软件构建靶点蛋白互作(PPI)网络,筛选关键靶点,将核心靶点导入DAVID数据库完成功能富集(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,采用GEO芯片进行核心靶点的外部验证和ROC分析,最后利用AutoDock软件进行分子对接验证.[结果]从丁香挥发油中共鉴定出 10 个主要成分,且均满足"类药五原则".预测到丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、酪氨酸蛋白激酶(SRC)、胱天蛋白酶 3(CASP3)等关键靶点,外部验证结果显示6个关键靶点表达均具有差异,TNF具有诊断价值.富集分析得到了 117个生物过程和 114 条信号通路.分子对接实验显示,大多数活性成分与其关键靶点具有良好的结合能力.[结论]丁香挥发油可能通过其中的活性成分如丁香酚等以及关键靶点如AKT1 等来调控信号传导、蛋白质磷酸化与细胞分化等多个生物学过程,从而协同发挥防治银屑病的作用.

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