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目的 探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值.方法 从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录组数据及对应患者的临床资料.筛选癌组织与正常肝组织差异表达的铜死亡相关基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.筛选与肝细胞癌预后相关的铜死亡lncRNA,对肝细胞癌患者进行分组并比较总体生存率.采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析建立预后风险模型.建立用于预测肝细胞癌患者总体生存率的列线图.结果 获得由5个铜死亡相关lncRNA组成的预后模型,包括:RPS6KA6、SNRPEP2、PRELID2、GOT2 和RTL8A.风险评分和TNM分期的列线图显示出该模型具有较好的预测能力.该预后模型与肿瘤免疫逃逸及免疫功能下相关基因的表达有关.结论 本研究成功构建的铜死亡相关lncRNA预后模型对预测HCC患者生存预后具有一定的准确性和可靠性,为铜死亡和HCC免疫之间的相互作用提供了线索.以铜死亡为核心的治疗有望为HCC治疗提供新的思路.

作者:马健钧;熊永强;王博;刘琪;李韧;张澍

来源:循证医学 2023 年 23卷 3期

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作者:
马健钧;熊永强;王博;刘琪;李韧;张澍
来源:
循证医学 2023 年 23卷 3期
标签:
肝细胞癌 铜死亡 lncRNA 预后模型 免疫功能 hepatocellular carcinoma cuproptosis lncRNA prognostic model immunity
目的 探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值.方法 从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录组数据及对应患者的临床资料.筛选癌组织与正常肝组织差异表达的铜死亡相关基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.筛选与肝细胞癌预后相关的铜死亡lncRNA,对肝细胞癌患者进行分组并比较总体生存率.采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析建立预后风险模型.建立用于预测肝细胞癌患者总体生存率的列线图.结果 获得由5个铜死亡相关lncRNA组成的预后模型,包括:RPS6KA6、SNRPEP2、PRELID2、GOT2 和RTL8A.风险评分和TNM分期的列线图显示出该模型具有较好的预测能力.该预后模型与肿瘤免疫逃逸及免疫功能下相关基因的表达有关.结论 本研究成功构建的铜死亡相关lncRNA预后模型对预测HCC患者生存预后具有一定的准确性和可靠性,为铜死亡和HCC免疫之间的相互作用提供了线索.以铜死亡为核心的治疗有望为HCC治疗提供新的思路.

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