目的 通过生物信息学方法筛选与分析脓毒症患者死亡的关键基因,为脓毒症基础研究提供新思路.方法 通过计算机在GEO数据库中搜索与脓毒症相关的基因库,选择出具有脓毒症患者外周血基因谱的数据库GSE54514,然后进行差异基因分析,包括GO和KEGG富集分析,使用STRING数据库建立差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,最后使用Cytoscape软件分析差异基因的相互作用,并筛选出前 10 个可能与脓毒症患者死亡相关的基因,后通过另一个脓毒症基因谱GSE137342 筛选出脓毒症患者与健康人的差异基因,寻找出两部分差异基因具有的共同差异基因,再进行详细分析.结果 通过GSE54514 筛选出脓毒症死亡患者与脓毒症未死亡患者之间具有 184个差异基因(92个上调基因和 92个下调基因),差异有统计学意义(P＜0.05).GO富集分析结果提示这些差异基因的生物过程主要富集于前体代谢物和能量的生成,蛋白质复合物组装的负调节,ATP代谢过程等;对于细胞成分主要富集于黏着斑、囊腔、胞质囊腔等;对于分子功能主要富集于钙黏蛋白结合,核糖体的结构成分,整合素结合等;KEGG富集分析结果提示这些差异基因的通路主要富集于糖尿病性心肌病、核糖体等,使用PPI网络确定了与脓毒症患者死亡相关的前 10 个关键基因,包括RPS17、RPS15A、RPL27、RPS27、
作者：谭明明；张津铭；邓逸斯；赵锋利；罗苑苑
来源：中国医药导报 2023 年 20卷 32期
