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目的 选用ITS2序列作为条形码来鉴定44种藏药材植物.方法 用高盐低pH法提取藏药材植物的基因组DNA,通过PCR扩增藏药材植物的ITS2序列,共得到ITS2序列145条,分属于24科,39属,44种.在GenBank数据库中通过序列比对选取了部分藏药材的同源序列.将ITS2序列在Bioedit软件中进行序列比对,在MEGA软件中计算双参数(K2P)种内和种间遗传距离,并基于邻接法构建系统进化树来分析物种的系统发育关系.结果 ITS2区域有显著的种内、种间差异,基于ITS2区域的系统进化分析与形态学结果一致,并可以反映物种之间的亲缘关系.此外,藏药材的ITS2序列二级结构各有不同,为物种鉴定提供了另一种方法.结论 ITS2序列是藏药材植物鉴定和系统发育研究的非常有效的单条形码,为藏药材植物资源的利用和保护提供了科学依据.

作者:郝豆豆;张勇群;付苏宏;施静;张鹏飞;拉多

来源:中草药 2019 年 50卷 12期

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作者:
郝豆豆;张勇群;付苏宏;施静;张鹏飞;拉多
来源:
中草药 2019 年 50卷 12期
标签:
藏药材植物 ITS2 分子鉴定 系统发生关系 PCR
目的 选用ITS2序列作为条形码来鉴定44种藏药材植物.方法 用高盐低pH法提取藏药材植物的基因组DNA,通过PCR扩增藏药材植物的ITS2序列,共得到ITS2序列145条,分属于24科,39属,44种.在GenBank数据库中通过序列比对选取了部分藏药材的同源序列.将ITS2序列在Bioedit软件中进行序列比对,在MEGA软件中计算双参数(K2P)种内和种间遗传距离,并基于邻接法构建系统进化树来分析物种的系统发育关系.结果 ITS2区域有显著的种内、种间差异,基于ITS2区域的系统进化分析与形态学结果一致,并可以反映物种之间的亲缘关系.此外,藏药材的ITS2序列二级结构各有不同,为物种鉴定提供了另一种方法.结论 ITS2序列是藏药材植物鉴定和系统发育研究的非常有效的单条形码,为藏药材植物资源的利用和保护提供了科学依据.

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