目的 以细辛药材为材料,采用高通量测序和生物信息学技术组装完整的叶绿体基因组序列,明确其结构特征、系统发育位置.方法 基于Illumina测序平台对细辛叶绿体基因组序列进行结构特征分析;同时,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建马兜铃科的系统发育关系.结果 华细辛和辽细辛叶绿体基因组全长为160 521～160 555 bp,表现出典型的四分体结构,且两者叶绿体基因组GC含量均为38.5％.细辛叶绿体基因组包含128个基因,其中85个蛋白质编码基因,34个tRNA基因,8个rRNA基因.此外,系统发育分析结果显示,基于完整的叶绿体基因组和蛋白编码数据集构建的拓扑树一致,细辛属物种和马蹄香属物种形成一个支持率的单系分支.结论 细辛叶绿体基因组测序、组装、结构特征分析,发现其大小介于 Asarum bracteolata 和 A.sieboldii var.seoulense 之间,IR 区存在 rpl16、rps19、ycf1、rpl23等基因扩张,研究结果丰富了细辛属植物遗传资源,为该属物种分子鉴定、系统发育以及野生资源保护与开发利用等研究提供理论基础.
作者：周军辉；鬲晓敏；李莎莎；陈尘；贾芸；张明英；柏国清
来源：中草药 2023 年 54卷 24期
