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目的 构建溶酶体相关基因的肝细胞癌预后预测模型并验证.方法 从癌基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库下载肝癌RNA-seq数据及临床数据.从Misdgb网站下载了 121个溶酶体相关基因.使用差异分析和单因素比例风险模型(COX)回归分析在TCGA中筛选出与肝癌患者总生存期有关的差异表达的溶酶体相关基因(P<0.05).利用最小绝对收缩和选择算子(Lasso)和COX回归分析构建预后预测模型.然后使用生存分析评估该模型,在ICGC中验证.并对该预后模型进行独立预后分析.结果 构建了由11个溶酶体相关基因构成的预后预测模型.生存分析显示,高风险组的生存率明显低于低风险组,差异有统计学意义(P<0.05).独立预后分析显示,该风险评分和肿瘤分期可作为预测肝癌的独立预后因素(P<0.05).结论 本研究构建了 11个溶酶体相关基因的预后预测模型,且风险评分可作为肝癌患者的独立预后因素.

作者:陈君;张宁

来源:中国临床药理学杂志 2023 年 39卷 24期

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作者:
陈君;张宁
来源:
中国临床药理学杂志 2023 年 39卷 24期
标签:
肝细胞癌 溶酶体相关基因 癌基因组图谱 国际癌症基因组联盟 预后模型 hepatocellular carcinoma lysosome-related genes the cancer genome atlas International Cancer Genome Consortium prognosis model
目的 构建溶酶体相关基因的肝细胞癌预后预测模型并验证.方法 从癌基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库下载肝癌RNA-seq数据及临床数据.从Misdgb网站下载了 121个溶酶体相关基因.使用差异分析和单因素比例风险模型(COX)回归分析在TCGA中筛选出与肝癌患者总生存期有关的差异表达的溶酶体相关基因(P<0.05).利用最小绝对收缩和选择算子(Lasso)和COX回归分析构建预后预测模型.然后使用生存分析评估该模型,在ICGC中验证.并对该预后模型进行独立预后分析.结果 构建了由11个溶酶体相关基因构成的预后预测模型.生存分析显示,高风险组的生存率明显低于低风险组,差异有统计学意义(P<0.05).独立预后分析显示,该风险评分和肿瘤分期可作为预测肝癌的独立预后因素(P<0.05).结论 本研究构建了 11个溶酶体相关基因的预后预测模型,且风险评分可作为肝癌患者的独立预后因素.

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