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目的:利用癌症基因图谱(TCGA)数据探讨线粒体溶质载体SLC25A39在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义.方法:从TCGA数据库下载HCC样本和正常肝组织的RNA-seq数据及临床信息,利用相关R语言软件包分析SLC25A39在HCC中的表达情况及其与临床病理指标、预后及免疫细胞浸润的相关性,并评估其在HCC中的诊断价值.结果:与正常组织相比,SLC25A39在HCC组织中表达上调(P<0.001),其表达水平与肿瘤T分期、病理分期、肿瘤状态、肿瘤残留、组织学分级及AFP水平显著相关(P<0.05),Cox回归模型分析显示SLC25A39高表达,是影响HCC患者总生存期(OS)的独立危险因素(HR=1.752,P=0.017).肿瘤免疫细胞浸润分析显示,SLC25A39与中性粒细胞、CD8+T细胞、中央记忆型T细胞(Tcm)、Gamma-Delta T细胞(Tgd)、Th2细胞和CD56bright NK细胞的浸润水平显著相关(|Spearman's r|>0.2,P<0.05).ROC曲线分析显示SLC25A39表达水平对HCC的早期诊断和预后均具有良好的评估价值(AUC均>0.50).结论:SLC25A39高表达是HCC预后不良的独立危险因素且具有良好的诊断价值,具有成为HCC诊断和预后评估生物标志物以及免疫治疗靶点的潜在价值.

作者:别蓓蓓;王亚;葛维娟;孙晋

来源:中国免疫学杂志 2023 年 39卷 5期

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作者:
别蓓蓓;王亚;葛维娟;孙晋
来源:
中国免疫学杂志 2023 年 39卷 5期
标签:
肝细胞癌 癌症基因图谱 线粒体溶质载体SLC25A39 生物标志物 临床意义
目的:利用癌症基因图谱(TCGA)数据探讨线粒体溶质载体SLC25A39在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义.方法:从TCGA数据库下载HCC样本和正常肝组织的RNA-seq数据及临床信息,利用相关R语言软件包分析SLC25A39在HCC中的表达情况及其与临床病理指标、预后及免疫细胞浸润的相关性,并评估其在HCC中的诊断价值.结果:与正常组织相比,SLC25A39在HCC组织中表达上调(P<0.001),其表达水平与肿瘤T分期、病理分期、肿瘤状态、肿瘤残留、组织学分级及AFP水平显著相关(P<0.05),Cox回归模型分析显示SLC25A39高表达,是影响HCC患者总生存期(OS)的独立危险因素(HR=1.752,P=0.017).肿瘤免疫细胞浸润分析显示,SLC25A39与中性粒细胞、CD8+T细胞、中央记忆型T细胞(Tcm)、Gamma-Delta T细胞(Tgd)、Th2细胞和CD56bright NK细胞的浸润水平显著相关(|Spearman's r|>0.2,P<0.05).ROC曲线分析显示SLC25A39表达水平对HCC的早期诊断和预后均具有良好的评估价值(AUC均>0.50).结论:SLC25A39高表达是HCC预后不良的独立危险因素且具有良好的诊断价值,具有成为HCC诊断和预后评估生物标志物以及免疫治疗靶点的潜在价值.

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