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目的 预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184 195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高.该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248 255位氨基酸残基或其附近.BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低.结论 结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础.

作者:崔瑞娜;白雪娟;阳幼荣;梁艳;张俊仙;赵卫国;吴雪琼

来源:中国人兽共患病学报 2015 年 31卷 6期

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作者:
崔瑞娜;白雪娟;阳幼荣;梁艳;张俊仙;赵卫国;吴雪琼
来源:
中国人兽共患病学报 2015 年 31卷 6期
标签:
结核分枝杆菌 Rv3134c蛋白 抗原表位 二级结构 预测 Mycobacterium tuberculosis Rv3134c protein epitope secondary structure prediction
目的 预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184 195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高.该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248 255位氨基酸残基或其附近.BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低.结论 结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础.

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