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目的 对水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster vims,VZV)Oka株gC基因进行克隆及序列分析.方法 取第40代Oka VZV疫苗株,反复冻融3次后,收集上清,提取病毒DNA,根据NCBI登录的Dumas株VZV序列,设计引物,扩增gC基因,与pMD19-T Vector连接后,热转化至E.coli Competent Cells JM109中,挑选阳性菌落进行测序;将得到的序列与GenBank中登录的其他12株VZV毒株的gC基因序列,进行核苷酸序列和氨基酸水平分析.结果 13株VZV-gC基因开放阅读框(ORF)的核苷酸长度为1 557~ 1776bp,编码的蛋白由519~ 592个氨基酸组成.核苷酸序列同源性在94.8%~ 100%之间,氨基酸序列同源性在93.9%~ 100%之间.R2重复拷贝数为7,Dumas、SVETA和Ellen重复拷贝数为6,LAX1为4.结论 VZV Oka株gC蛋白具有高度的保守性,与其功能的发挥密切相关.

作者:何云松;文崇艳;麻广;邹蔚然;刘亚宇;李立;刘晔

来源:中国生物制品学杂志 2017 年 30卷 6期

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作者:
何云松;文崇艳;麻广;邹蔚然;刘亚宇;李立;刘晔
来源:
中国生物制品学杂志 2017 年 30卷 6期
标签:
水痘-带状疱疹病毒 Oka株 gC基因 序列分析 Varicella-zoster virus (VZV) Oka strain gC gene Sequence analysis
目的 对水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster vims,VZV)Oka株gC基因进行克隆及序列分析.方法 取第40代Oka VZV疫苗株,反复冻融3次后,收集上清,提取病毒DNA,根据NCBI登录的Dumas株VZV序列,设计引物,扩增gC基因,与pMD19-T Vector连接后,热转化至E.coli Competent Cells JM109中,挑选阳性菌落进行测序;将得到的序列与GenBank中登录的其他12株VZV毒株的gC基因序列,进行核苷酸序列和氨基酸水平分析.结果 13株VZV-gC基因开放阅读框(ORF)的核苷酸长度为1 557~ 1776bp,编码的蛋白由519~ 592个氨基酸组成.核苷酸序列同源性在94.8%~ 100%之间,氨基酸序列同源性在93.9%~ 100%之间.R2重复拷贝数为7,Dumas、SVETA和Ellen重复拷贝数为6,LAX1为4.结论 VZV Oka株gC蛋白具有高度的保守性,与其功能的发挥密切相关.

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