目的 通过大数据挖掘与实验相结合,探讨CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌FPKM数据,通过R软件及其相关软件包依次进行CDK5与PD-L1表达及其相关性分析、CDK5高低表达分组的差异基因的基因本体(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,以及CDK5与免疫检查点、免疫细胞间相关性等生物信息学分析;通过CCK-8、Transwell、实时PCR、Western blotting、流式细胞术等检测CDK5抑制剂20-223对胃癌BGC-823细胞增殖、迁移、PD-L1表达、细胞周期及凋亡等的影响.结果 通过大数据发现CDK5在多种癌症中均高表达;CDK5与PD-L1在胃癌中高表达,且呈正相关.CDK5抑制剂抑制CDK5后,胃癌BGC-823细胞PD-L1蛋白的表达下降(P= 0.0134),PD-L1mRNA表达水平也下降(P= 0.0004);过表达CDK5上调PD-L1mRNA表达(P= 0.0059).CDK5抑制剂可显著抑制IFN-γ促进的PD-L1转录(P<0.0001).抑制CDK5后,细胞周期阻滞于G2/M期;细胞凋亡增加,40 μmol/L组总凋亡细胞比例高于对照组(P= 0.0377),80 μmol/L组总凋亡较40 μmol/L组进一步增加(P= 0.0005);细胞迁移减少,Transwell实验结果显示,CDK5抑制剂组细胞穿过数量明显低于对照组(P= 0.0025);划痕实验结果显示,CDK5抑制剂组迁移率明显低于对照

作者：黄谊强；王子明；罗杨；罗水妹；谢贤和；张帆

来源：中国医科大学学报 2023 年 52卷 9期